pK-eCFP

176559 Synthetic Yeast Expression

Plasmid Information

Purpose
Expression of eCFP for auxotrophic selection in the absence of histidine
Depositor
Markus Ralser
Article
Olin-Sandoval et al Nature. 2019 Aug;572(7768):249-253. doi:
Insert
eCFP
Promoter
TDH1(GAP)
Available Since
Dec. 23, 2021
Availability
Available

Sequence Information

Length
9,761 bp
Topology
circular
Molecule Type
other DNA

Features

CDS 3
Label Gene Product Position Strand
LYS2 S. cerevisiae LYS2 alpha-aminoadipate reductase, required … 404..4583 Fwd
DNA Sequence
ATGACTAACGAAAAGGTCTGGATAGAGAAGTTGGATAATCCAACTCTTTCAGTGTTACCACATGACTTTTTACGCCCACAACAAGAACCTTATACGAAACAAGCTACATATTCGTTACAGCTACCTCAGCTCGATGTGCCTCATGATAGTTTTTCTAACAAATACGCTGTCGCTTTGAGTGTATGGGCTGCATTGATATATAGAGTAACCGGTGACGATGATATTGTTCTTTATATTGCGAATAACAAAATCTTAAGATTCAATATTCAACCAACGTGGTCATTTAATGAGCTGTATTCTACAATTAACAATGAGTTGAACAAGCTCAATTCTATTGAGGCCAATTTTTCCTTTGACGAGCTAGCTGAAAAAATTCAAAGTTGCCAAGATCTGGAAAGGACCCCTCAGTTGTTCCGTTTGGCCTTTTTGGAAAACCAAGATTTCAAATTAGACGAGTTCAAGCATCATTTAGTGGACTTTGCTTTGAATTTGGATACCAGTAATAATGCGCATGTTTTGAACTTAATTTATAACAGCTTACTGTATTCGAATGAAAGAGTAACCATTGTTGCGGACCAATTTACTCAATATTTGACTGCTGCGCTAAGCGATCCATCCAATTGCATAACTAAAATCTCTCTGATCACCGCATCATCCAAGGATAGTTTACCTGATCCAACTAAGAACTTGGGCTGGTGCGATTTCGTGGGGTGTATTCACGACATTTTCCAGGACAATGCTGAAGCCTTCCCAGAGAGAACCTGTGTTGTGGAGACTCCAACACTAAATTCCGACAAGTCCCGTTCTTTCACTTATCGCGACATCAACCGCACTTCTAACATAGTTGCCCATTATTTGATTAAAACAGGTATCAAAAGAGGTGATGTAGTGATGATCTATTCTTCTAGGGGTGTGGATTTGATGGTATGTGTGATGGGTGTCTTGAAAGCCGGCGCAACCTTTTCAGTTATCGACCCTGCATATCCCCCAGCCAGACAAACCATTTACTTAGGTGTTGCTAAACCACGTGGGTTGATTGTTATTAGAGCTGCTGGACAATTGGATCAACTAGTAGAAGATTACATCAATGATGAATTGGAGATTGTTTCAAGAATCAATTCCATCGCTATTCAAGAAAATGGTACCATTGAAGGTGGCAAATTGGACAATGGCGAGGATGTTTTGGCTCCATATGATCACTACAAAGACACCAGAACAGGTGTTGTAGTTGGACCAGATTCCAACCCAACCCTATCTTTCACATCTGGTTCCGAAGGTATTCCTAAGGGTGTTCTTGGTAGACATTTTTCCTTGGCTTATTATTTCAATTGGATGTCCAAAAGGTTCAACTTAACAGAAAATGATAAATTCACAATGCTGAGCGGTATTGCACATGATCCAATTCAAAGAGATATGTTTACACCATTATTTTTAGGTGCCCAATTGTATGTCCCTACTCAAGATGATATTGGTACACCGGGCCGTTTAGCGGAATGGATGAGTAAGTATGGTTGCACAGTTACCCATTTAACACCTGCCATGGGTCAATTACTTACTGCCCAAGCTACTACACCATTCCCTAAGTTACATCATGCGTTCTTTGTGGGTGACATTTTAACAAAACGTGATTGTCTGAGGTTACAAACCTTGGCAGAAAATTGCCGTATTGTTAATATGTACGGTACCACTGAAACACAGCGTGCAGTTTCTTATTTCGAAGTTAAATCAAAAAATGACGATCCAAACTTTTTGAAAAAATTGAAAGATGTCATGCCTGCTGGTAAAGGTATGTTGAACGTTCAGCTACTAGTTGTTAACAGGAACGATCGTACTCAAATATGTGGTATTGGCGAAATAGGTGAGATTTATGTTCGTGCAGGTGGTTTGGCCGAAGGTTATAGAGGATTACCAGAATTGAATAAAGAAAAATTTGTGAACAACTGGTTTGTTGAAAAAGATCACTGGAATTATTTGGATAAGGATAATGGTGAACCTTGGAGACAATTCTGGTTAGGTCCAAGAGATAGATTGTACAGAACGGGTGATTTAGGTCGTTATCTACCAAACGGTGACTGTGAATGTTGCGGTAGGGCTGATGATCAAGTTAAAATTCGTGGGTTCAGAATCGAATTAGGAGAAATAGATACGCACATTTCCCAACATCCATTGGTAAGAGAAAACATTACTTTAGTTCGCAAAAATGCCGACAATGAGCCAACATTGATCACATTTATGGTCCCAAGATTTGACAAGCCAGATGACTTGTCTAAGTTCCAAAGTGATGTTCCAAAGGAGGTTGAAACTGACCCTATAGTTAAGGGCTTAATCGGTTACCATCTTTTATCCAAGGACATCAGGACTTTCTTAAAGAAAAGATTGGCTAGCTATGCTATGCCTTCCTTGATTGTGGTTATGGATAAACTACCATTGAATCCAAATGGTAAAGTTGATAAGCCTAAACTTCAATTCCCAACTCCCAAGCAATTAAATTTGGTAGCTGAAAATACAGTTTCTGAAACTGACGACTCTCAGTTTACCAATGTTGAGCGCGAGGTTAGAGACTTATGGTTAAGTATATTACCTACCAAGCCAGCATCTGTATCACCAGATGATTCGTTTTTCGATTTAGGTGGTCATTCTATCTTGGCTACCAAAATGATTTTTACCTTAAAGAAAAAGCTGCAAGTTGATTTACCATTGGGCACAATTTTCAAGTATCCAACGATAAAGGCCTTTGCCGCGGAAATTGACAGAATTAAATCATCGGGTGGATCATCTCAAGGTGAGGTCGTCGAAAATGTCACTGCAAATTATGCGGAAGACGCCAAGAAATTGGTTGAGACGCTACCAAGTTCGTACCCCTCTCGAGAATATTTTGTTGAACCTAATAGTGCCGAAGGAAAAACAACAATTAATGTGTTTGTTACCGGTGTCACAGGATTTCTGGGCTCCTACATCCTTGCAGATTTGTTAGGACGTTCTCCAAAGAACTACAGTTTCAAAGTGTTTGCCCACGTCAGGGCCAAGGATGAAGAAGCTGCATTTGCAAGATTACAAAAGGCAGGTATCACCTATGGTACTTGGAACGAAAAATTTGCCTCAAATATTAAAGTTGTATTAGGCGATTTATCTAAAAGCCAATTTGGTCTTTCAGATGAGAAGTGGATGGATTTGGCAAACACAGTTGATATAATTATCCATAATGGTGCGTTAGTTCACTGGGTTTATCCATATGCCAAATTGAGGGATCCAAATGTTATTTCAACTATCAATGTTATGAGCTTAGCCGCCGTCGGCAAGCCAAAGTTCTTTGACTTTGTTTCCTCCACTTCTACTCTTGACACTGAATACTACTTTAATTTGTCAGATAAACTTGTTAGCGAAGGGAAGCCAGGCATTTTAGAATCAGACGATTTAATGAACTCTGCAAGCGGGCTCACTGGTGGATATGGTCAGTCCAAATGGGCTGCTGAGTACATCATTAGACGTGCAGGTGAAAGGGGCCTACGTGGGTGTATTGTCAGACCAGGTTACGTAACAGGTGCCTCTGCCAATGGTTCTTCAAACACAGATGATTTCTTATTGAGATTTTTGAAAGGTTCAGTCCAATTAGGTAAGATTCCAGATATCGAAAATTCCGTGAATATGGTTCCAGTAGATCATGTTGCTCGTGTTGTTGTTGCTACGTCTTTGAATCCTCCCAAAGAAAATGAATTGGCCGTTGCTCAAGTAACGGGTCACCCAAGAATATTATTCAAAGACTACTTGTATACTTTACACGATTATGGTTACGATGTCGAAATCGAAAGCTATTCTAAATGGAAGAAATCATTGGAGGCGTCTGTTATTGACAGGAATGAAGAAAATGCGTTGTATCCTTTGCTACACATGGTCTTAGACAACTTACCTGAAAGTACCAAAGCTCCGGAACTAGACGATAGGAACGCCGTGGCATCTTTAAAGAAAGACACCGCATGGACAGGTGTTGATTGGTCTAATGGAATAGGTGTTACTCCAGAAGAGGTTGGTATATATATTGCATTTTTAAACAAGGTTGGATTTTTACCTCCACCAACTCATAATGACAAACTTCCACTGCCAAGTATAGAACTAACTCAAGCGCAAATAAGTCTAGTTGCTTCAGGTGCTGGTGCTCGTGGAAGCTCCGCAGCAGCTTAA
Protein Sequence
MTNEKVWIEKLDNPTLSVLPHDFLRPQQEPYTKQATYSLQLPQLDVPHDSFSNKYAVALSVWAALIYRVTGDDDIVLYIANNKILRFNIQPTWSFNELYSTINNELNKLNSIEANFSFDELAEKIQSCQDLERTPQLFRLAFLENQDFKLDEFKHHLVDFALNLDTSNNAHVLNLIYNSLLYSNERVTIVADQFTQYLTAALSDPSNCITKISLITASSKDSLPDPTKNLGWCDFVGCIHDIFQDNAEAFPERTCVVETPTLNSDKSRSFTYRDINRTSNIVAHYLIKTGIKRGDVVMIYSSRGVDLMVCVMGVLKAGATFSVIDPAYPPARQTIYLGVAKPRGLIVIRAAGQLDQLVEDYINDELEIVSRINSIAIQENGTIEGGKLDNGEDVLAPYDHYKDTRTGVVVGPDSNPTLSFTSGSEGIPKGVLGRHFSLAYYFNWMSKRFNLTENDKFTMLSGIAHDPIQRDMFTPLFLGAQLYVPTQDDIGTPGRLAEWMSKYGCTVTHLTPAMGQLLTAQATTPFPKLHHAFFVGDILTKRDCLRLQTLAENCRIVNMYGTTETQRAVSYFEVKSKNDDPNFLKKLKDVMPAGKGMLNVQLLVVNRNDRTQICGIGEIGEIYVRAGGLAEGYRGLPELNKEKFVNNWFVEKDHWNYLDKDNGEPWRQFWLGPRDRLYRTGDLGRYLPNGDCECCGRADDQVKIRGFRIELGEIDTHISQHPLVRENITLVRKNADNEPTLITFMVPRFDKPDDLSKFQSDVPKEVETDPIVKGLIGYHLLSKDIRTFLKKRLASYAMPSLIVVMDKLPLNPNGKVDKPKLQFPTPKQLNLVAENTVSETDDSQFTNVEREVRDLWLSILPTKPASVSPDDSFFDLGGHSILATKMIFTLKKKLQVDLPLGTIFKYPTIKAFAAEIDRIKSSGGSSQGEVVENVTANYAEDAKKLVETLPSSYPSREYFVEPNSAEGKTTINVFVTGVTGFLGSYILADLLGRSPKNYSFKVFAHVRAKDEEAAFARLQKAGITYGTWNEKFASNIKVVLGDLSKSQFGLSDEKWMDLANTVDIIIHNGALVHWVYPYAKLRDPNVISTINVMSLAAVGKPKFFDFVSSTSTLDTEYYFNLSDKLVSEGKPGILESDDLMNSASGLTGGYGQSKWAAEYIIRRAGERGLRGCIVRPGYVTGASANGSSNTDDFLLRFLKGSVQLGKIPDIENSVNMVPVDHVARVVVATSLNPPKENELAVAQVTGHPRILFKDYLYTLHDYGYDVEIESYSKWKKSLEASVIDRNEENALYPLLHMVLDNLPESTKAPELDDRNAVASLKKDTAWTGVDWSNGIGVTPEEVGIYIAFLNKVGFLPPPTHNDKLPLPSIELTQAQISLVASGAGARGSSAAA
yeGFP yeast-enhanced green fluorescent protein 6025..6742 Fwd
DNA Sequence
ATGTCTAAAGGTGAAGAATTATTCACTGGTGTTGTCCCAATTTTGGTTGAATTAGATGGTGATGTTAATGGTCACAAATTTTCTGTCTCCGGTGAAGGTGAAGGTGATGCTACTTACGGTAAATTGACCTTAAAATTTATTTGTACTACTGGTAAATTGCCAGTTCCATGGCCAACCTTAGTCACTACTTTAACTTGGGGTGTTCAATGTTTTTCTAGATACCCAGATCATATGAAACAACATGACTTTTTCAAGTCTGCCATGCCAGAAGGTTATGTTCAAGAAAGAACTATTTTTTTCAAAGATGACGGTAACTACAAGACCAGAGCTGAAGTCAAGTTTGAAGGTGATACCTTAGTTAATAGAATCGAATTAAAAGGTATTGATTTTAAAGAAGATGGTAACATTTTAGGTCACAAATTGGAATACATTTATAACTCTCACAATGTTTACATCACTGCTGACAAACAAAAGAATGGTATCAAAGCTAACTTCAAAATTAGACACAACATTGAAGATGGTTCTGTTCAATTAGCTGACCATTATCAACAAAATACTCCAATTGGTGATGGTCCAGTCTTGTTACCAGACAACCATTACTTATCCACTCAATCTGCCTTATCCAAAGATCCAAACGAAAAGAGAGACCACATGGTCTTGTTAGAATTTGTTACTGCTGCTGGTATTACCCATGGTATTGATGAATTGTACAAATAA
Protein Sequence
MSKGEELFTGVVPILVELDGDVNGHKFSVSGEGEGDATYGKLTLKFICTTGKLPVPWPTLVTTLTWGVQCFSRYPDHMKQHDFFKSAMPEGYVQERTIFFKDDGNYKTRAEVKFEGDTLVNRIELKGIDFKEDGNILGHKLEYIYNSHNVYITADKQKNGIKANFKIRHNIEDGSVQLADHYQQNTPIGDGPVLLPDNHYLSTQSALSKDPNEKRDHMVLLEFVTAAGITHGIDELYK
AmpR bla beta-lactamase 8187..9048 Rev
DNA Sequence
ATGAGTATTCAACATTTCCGTGTCGCCCTTATTCCCTTTTTTGCGGCATTTTGCCTTCCTGTTTTTGCTCACCCAGAAACGCTGGTGAAAGTAAAAGATGCTGAAGATCAGTTGGGTGCACGAGTGGGTTACATCGAACTGGATCTCAACAGCGGTAAGATCCTTGAGAGTTTTCGCCCCGAAGAACGTTTTCCAATGATGAGCACTTTTAAAGTTCTGCTATGTGGCGCGGTATTATCCCGTATTGACGCCGGGCAAGAGCAACTCGGTCGCCGCATACACTATTCTCAGAATGACTTGGTTGAGTACTCACCAGTCACAGAAAAGCATCTTACGGATGGCATGACAGTAAGAGAATTATGCAGTGCTGCCATAACCATGAGTGATAACACTGCGGCCAACTTACTTCTGACAACGATCGGAGGACCGAAGGAGCTAACCGCTTTTTTGCACAACATGGGGGATCATGTAACTCGCCTTGATCGTTGGGAACCGGAGCTGAATGAAGCCATACCAAACGACGAGCGTGACACCACGATGCCTGTAGCAATGGCAACAACGTTGCGCAAACTATTAACTGGCGAACTACTTACTCTAGCTTCCCGGCAACAATTAATAGACTGGATGGAGGCGGATAAAGTTGCAGGACCACTTCTGCGCTCGGCCCTTCCGGCTGGCTGGTTTATTGCTGATAAATCTGGAGCCGGTGAGCGTGGGTCTCGCGGTATCATTGCAGCACTGGGGCCAGATGGTAAGCCCTCCCGTATCGTAGTTATCTACACGACGGGGAGTCAGGCAACTATGGATGAACGAAATAGACAGATCGCTGAGATAGGTGCCTCACTGATTAAGCATTGGTAA
Protein Sequence
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRIDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPVAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
promoter 6
Label Gene Product Position Strand
LYS2 promoter S. cerevisiae LYS2 164..404 Fwd
DNA Sequence
AATTCCACTTGCAATTACATAAAAAATTCCGGCGGTTTTTCGCGTGTGACTCAATGTCGAAATACCTGCCTAATGAACATGAACATCGCCCAAATGTATTTGAAGACCCGCTGGGAGAAGTTCAAGATATATAAGTAACAAGCAGCCAATAGTATAAAAAAAAATCTGAGTTTATTACCTTTCCTGGAATTTCAGTGAAAAACTGCTAATTATAGAGAGATATCACAGAGTTACTCACTA
T7 promoter 5289..5308 Fwd
DNA Sequence
TAATACGACTCACTATAGG
GAP promoter S. cerevisiae TDH3 5334..6001 Fwd
DNA Sequence
TCATTATCAATACTGCCATTTCAAAGAATACGTAAATAATTAATAGTAGTGATTTTCCTAACTTTATTTAGTCAAAAAATTAGCCTTTTAATTCTGCTGTAACCCGTACATGCCCAAAATAGGGGGCGGGTTACACAGAATATATAACATCGTAGGTGTCTGGGTGAACAGTTTATTCCTGGCATCCACTAAATATAATGGAGCCCGCTTTTTAAGCTGGCATCCAGAAAAAAAAAGAATCCCAGCACCAAAATATTGTTTTCTTCACCAACCATCAGTTCATAGGTCCATTCTCTTAGCGCAACTACAGAGAACAGGGGCACAAACAGGCAAAAAACGGGCACAACCTCAATGGAGTGATGCAACCTGCCTGGAGTAAATGATGACACAAGGCAATTGACCCACGCATGTATCTATCTCATTTTCTTACACCTTCTATTACCTTCTGCTCTCTCTGATTTGGAAAAAGCTGAAAAAAAAGGTTGAAACCAGTTCCCTGAAATTATTCCCCTACTTGACTAATAAGTATATAAAGACGGTAGGTATTGATTGTAATTCTGTAAATCTATTTCTTAAACTTCTTAAATTCTACTTTTATAGTTAGTCTTTTTTTTAGTTTTAAAACACCAAGAACTTAGTTTCGAATAAACACACATAAACAAACAAA
T3 promoter 6987..7006 Rev
DNA Sequence
AATTAACCCTCACTAAAGG
lac promoter 7074..7105 Rev
DNA Sequence
TTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTG
AmpR promoter bla 9048..9153 Rev
DNA Sequence
CGCGGAACCCCTATTTGTTTATTTTTCTAAATACATTCAAATATGTATCCGCTCATGAGACAATAACCCTGATAAATGCTTCAATAATATTGAAAAAGGAAGAGT
protein_bind 2
Label Gene Product Position Strand
lac operator 7050..7067 Fwd
DNA Sequence
TTGTTATCCGCTCACAA
CAP binding site 7119..7141 Fwd
DNA Sequence
ATGAGTGAGCTAACTCACATTA
rep_origin 2
Label Gene Product Position Strand
f1 ori 4670..5126 Rev
DNA Sequence
ACGCGCCCTGTAGCGGCGCATTAAGCGCGGCGGGTGTGGTGGTTACGCGCAGCGTGACCGCTACACTTGCCAGCGCCCTAGCGCCCGCTCCTTTCGCTTTCTTCCCTTCCTTTCTCGCCACGTTCGCCGGCTTTCCCCGTCAAGCTCTAAATCGGGGGCTCCCTTTAGGGTTCCGATTTAGTGCTTTACGGCACCTCGACCCCAAAAAACTTGATTAGGGTGATGGTTCACGTAGTGGGCCATCGCCCTGATAGACGGTTTTTCGCCCTTTGACGTTGGAGTCCACGTTCTTTAATAGTGGACTCTTGTTCCAAACTGGAACAACACTCAACCCTATCTCGGTCTATTCTTTTGATTTATAAGGGATTTTGCCGATTTCGGCCTATTGGTTAAAAAATGAGCTGATTTAACAAAAATTTAACGCGAATTTTAACAAAATATTAACGCTTACAATTT
ori 7428..8017 Rev
DNA Sequence
TTGAGATCCTTTTTTTCTGCGCGTAATCTGCTGCTTGCAAACAAAAAAACCACCGCTACCAGCGGTGGTTTGTTTGCCGGATCAAGAGCTACCAACTCTTTTTCCGAAGGTAACTGGCTTCAGCAGAGCGCAGATACCAAATACTGTTCTTCTAGTGTAGCCGTAGTTAGGCCACCACTTCAAGAACTCTGTAGCACCGCCTACATACCTCGCTCTGCTAATCCTGTTACCAGTGGCTGCTGCCAGTGGCGATAAGTCGTGTCTTACCGGGTTGGACTCAAGACGATAGTTACCGGATAAGGCGCAGCGGTCGGGCTGAACGGGGGGTTCGTGCACACAGCCCAGCTTGGAGCGAACGACCTACACCGAACTGAGATACCTACAGCGTGAGCTATGAGAAAGCGCCACGCTTCCCGAAGGGAGAAAGGCGGACAGGTATCCGGTAAGCGGCAGGGTCGGAACAGGAGAGCGCACGAGGGAGCTTCCAGGGGGAAACGCCTGGTATCTTTATAGTCCTGTCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAA
terminator 1
Label Gene Product Position Strand
ADH1 terminator S. cerevisiae ADH1 6762..6950 Fwd
DNA Sequence
GCGAATTTCTTATGATTTATGATTTTTATTATTAAATAAGTTATAAAAAAAATAAGTGTATACAAATTTTAAAGTGACTCTTAGGTTTTAAAACGAAAATTCTTATTCTTGAGTAACTCTTTCCTGTAGGTCAGGTTGCTTTCTCAGGTATAGTATGAGGTCGCTCTTATTGACCACACCTCTACCGG