KanR

CDS antibiotic_resistance

Feature Information

Gene
aph(3')-Ia
Product
aminoglycoside phosphotransferase
Note
confers resistance to kanamycin in bacteria or G418 (Geneticin(R)) in eukaryotes
Type
CDS
Category
antibiotic_resistance

Protein Sequence

271 amino acids
MSHIQRETSCSRPRLNSNMDADLYGYKWARDNVGQSGATIYRLYGKPDAPELFLKHGKGSVANDVTDEMVRLNWLTEFMPLPTIKHFIRTPDDAWLLTTAIPGKTAFQVLEEYPDSGENIVDALAVFLRRLHSIPVCNCPFNSDRVFRLAQAQSRMNKGLVDASDFDDERNGWPVEQVWKEMHKLLPFSPDSVVTHGDFSLDNLIFDEGKLIGCIDVGRVGIADRYQDLAILWNCLGEFSPSLQKRLFQKYGIDNPDMNKLQFHLMLDEFF

Found in 4,204 Plasmids (showing 1801–1850)

Plasmid Species Position Strand
MDO2-c003 173105 Homo sapiens 3369..4185 Rev
MDO2-c005 173106 Homo sapiens 2067..2883 Rev
PARG-c002 173107 Homo sapiens 3159..3975 Rev
TARG1-c002 173108 Homo sapiens 2025..2841 Rev
GDAP2-c005 173110 Homo sapiens 2262..3078 Rev
ALC1-c007 173112 Homo sapiens 2157..2973 Rev
pENTR-D-kcnj1a.1 173125 Danio rerio 2109..2919 Fwd
pENTR-D-kcnj1b 173126 Danio rerio 2101..2911 Fwd
pDONR221-kcnj2a 173127 Danio rerio 2227..3037 Fwd
pDONR221-kcnj2b 173128 Danio rerio 2266..3076 Fwd
pDONR221-kcnj3a 173129 Danio rerio 2416..3226 Fwd
pDONR221-kcnj3b 173130 Danio rerio 2563..3373 Fwd
pDONR221-kcnj4 173131 Danio rerio 2440..3250 Fwd
pDONR221-kcnj5 173132 Danio rerio 2221..3031 Fwd
pDONR221-kcnj6 173133 Danio rerio 2152..2962 Fwd
pDONR221-kcnj8 173134 Danio rerio 2114..2924 Fwd
pDONR221-kcnj9 173135 Danio rerio 2455..3265 Fwd
pENTR-D-kcnj10a 173137 Danio rerio 2251..3061 Fwd
pENTR-D-kcnj10b 173138 Danio rerio 2185..2995 Fwd
pDONR221-kcnj11 173139 Danio rerio 2089..2899 Fwd
pDONR221-kcnj11l 173140 Danio rerio 2242..3052 Fwd
pDONR221-kcnj12a 173141 Danio rerio 2260..3070 Fwd
pDONR221-kcnj12b 173142 Danio rerio 2209..3019 Fwd
pENTR-D-kcnj13 173143 Danio rerio 2062..2872 Fwd
pDONR221-kcnj14 173144 Danio rerio 2575..3385 Fwd
pENTR-D-kcnj15 173145 Danio rerio 1981..2791 Fwd
pENTR-D-kcnj16 173146 Danio rerio 2002..2812 Fwd
pDONR221-kcnj19a 173148 Danio rerio 2458..3268 Fwd
pDONR221-kcnj19b 173149 Danio rerio 2461..3271 Fwd
pDONR221-kcnj20 173150 Danio rerio 2128..2938 Fwd
pDONR221-kcnj21 173151 Danio rerio 2243..3053 Fwd
spMSP1D1 173482 Synthetic 558..1374 Rev
spNW15 173483 Synthetic 3294..4110 Rev
spNW25 173484 Synthetic 558..1374 Rev
spNW30 173485 Synthetic 558..1374 Rev
spNW50 173486 Synthetic 558..1374 Rev
spNW80 173487 Synthetic 558..1374 Rev
spNW100 173488 Synthetic 558..1374 Rev
pUFlip-floxed2A-mRFP-; gcry1:BFP -0 173886 Danio rerio 6287..7097 Fwd
pUFlip-floxed2A-mRFP-; gcry1:BFP -1 173887 Danio rerio 6118..6928 Fwd
pUFlip-floxed2A-mRFP-; gcry1:BFP -2 173888 Danio rerio 6251..7061 Fwd
pUFlip-floxed2A-KalTA4-; gcry1:BFP -0 173889 Danio rerio 6140..6950 Fwd
pUFlip-floxed2A-KalTA4-; gcry1:BFP -1 173890 Danio rerio 6159..6969 Fwd
pUFlip-floxed2A-KalTA4-; gcry1:BFP -2 173891 Danio rerio 6116..6926 Fwd
pCMV-Spike 173921 Homo sapiens 6363..7173 Rev
pCMV-Spike-VLP 173922 Homo sapiens 8073..8883 Rev
pET41sIII_GST-ALC1 173932 Homo sapiens 5700..6516 Rev
pET28_6xHis-PARP1delZn1 173933 Homo sapiens 5022..5838 Rev
pET28_6xHis-PARP1delZn3-L713F 173934 Homo sapiens 2753..3569 Fwd
pET28_6xHis-PARP1delZn2 173935 Homo sapiens 3507..4323 Rev

DNA Sequence Variants

Sequence context may differ across plasmids due to position and neighboring features.

DNA Sequence (816 bp)
ATGAGCCATATTCAACGGGAAACGTCTTGCTCTAGGCCGCGATTAAATTCCAACATGGATGCTGATTTATATGGGTATAAATGGGCTCGCGATAATGTCGGGCAATCAGGTGCGACAATCTATCGATTGTATGGGAAGCCCGATGCGCCAGAGTTGTTTCTGAAACATGGCAAAGGTAGCGTTGCCAATGATGTTACAGATGAGATGGTCAGACTAAACTGGCTGACGGAATTTATGCCTCTTCCGACCATCAAGCATTTTATCCGTACTCCTGATGATGCATGGTTACTCACCACTGCGATCCCCGGGAAAACAGCATTCCAGGTATTAGAAGAATATCCTGATTCAGGTGAAAATATTGTTGATGCGCTGGCAGTGTTCCTGCGCCGGTTGCATTCGATTCCTGTTTGTAATTGTCCTTTTAACAGCGATCGCGTATTTCGTCTCGCTCAGGCGCAATCACGAATGAATAACGGTTTGGTTGATGCGAGTGATTTTGATGACGAGCGTAATGGCTGGCCTGTTGAACAAGTCTGGAAAGAAATGCATAAACTTTTGCCATTCTCACCGGATTCAGTCGTCACTCATGGTGATTTCTCACTTGATAACCTTATTTTTGACGAGGGGAAATTAATAGGTTGTATTGATGTTGGACGAGTCGGAATCGCAGACCGATACCAGGATCTTGCCATCCTATGGAACTGCCTCGGTGAGTTTTCTCCTTCATTACAGAAACGGCTTTTTCAAAAATATGGTATTGATAATCCTGATATGAATAAATTGCAGTTTCATTTGATGCTCGATGAGTTTTTCTAA
Protein Sequence (271 aa)
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DNA Sequence (816 bp)
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Protein Sequence (271 aa)
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DNA Sequence (816 bp)
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DNA Sequence (816 bp)
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DNA Sequence (816 bp)
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Protein Sequence (269 aa)
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DNA Sequence (810 bp)
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