KanR

CDS antibiotic_resistance

Feature Information

Gene
aph(3')-Ia
Product
aminoglycoside phosphotransferase
Note
confers resistance to kanamycin in bacteria or G418 (Geneticin(R)) in eukaryotes
Type
CDS
Category
antibiotic_resistance

Protein Sequence

271 amino acids
MSHIQRETSCSRPRLNSNMDADLYGYKWARDNVGQSGATIYRLYGKPDAPELFLKHGKGSVANDVTDEMVRLNWLTEFMPLPTIKHFIRTPDDAWLLTTAIPGKTAFQVLEEYPDSGENIVDALAVFLRRLHSIPVCNCPFNSDRVFRLAQAQSRMNKGLVDASDFDDERNGWPVEQVWKEMHKLLPFSPDSVVTHGDFSLDNLIFDEGKLIGCIDVGRVGIADRYQDLAILWNCLGEFSPSLQKRLFQKYGIDNPDMNKLQFHLMLDEFF

Found in 4,204 Plasmids (showing 51–100)

Plasmid Species Position Strand
PTP1B human 102719 Homo sapiens 879..1695 Rev
pET28a-SpyTag002-MBP 102831 Synthetic 2053..2869 Rev
pET28a-SpyTag002 DA-MBP 102832 Synthetic 2053..2869 Rev
pG2J 102882 Oryza sativa 5951..6761 Fwd
pOsTIR1w/oGFP 102883 Oryza sativa 2975..3785 Fwd
pUD628 103018 Saccharomyces cerevisiae 749..1559 Fwd
pUDE710 103020 Saccharomyces cerevisiae 793..1603 Fwd
pUDE714 103021 Saccharomyces cerevisiae 749..1559 Fwd
pUDE722 103022 Saccharomyces cerevisiae 749..1559 Fwd
pUDE735 103024 Saccharomyces cerevisiae 881..1691 Fwd
CFP-FRBx5-His 103784 Synthetic 558..1374 Rev
YFP-FKBPx5-His 103785 Synthetic 3698..4514 Rev
pHES553 [prGal1-RAS2(KAN) pnh604] 103846 Saccharomyces cerevisiae 3972..4782 Fwd
pVZ_PcoaT_SQE1_CAS1 103856 Arabidopsis thaliana 427..1243 Rev
pVZ_PcoaT_SQE1_LUP1 103857 Arabidopsis thaliana 427..1243 Rev
pVZ_PcoaT_SQE1_MRN1 103858 Arabidopsis thaliana 12905..13721 Fwd
pVZ_PcoaT_SQE1_THAS1 103859 Arabidopsis thaliana 427..1243 Rev
pVZ_PcoaT_SQE1 103860 Arabidopsis thaliana 427..1243 Rev
pET251-pUC 12xMS2V6 Loxp KANr Loxp 104392 Synthetic 1512..2322 Fwd
pET264-pUC 24xMS2V6 Loxp KANr Loxp 104393 Synthetic 349..1159 Fwd
PIA586 104399 Escherichia coli 3828..4644 Rev
hnRNPA2_LC_P298L 104465 Homo sapiens 902..1718 Rev
MBP-hnRNPA2_LC_R191K_R254K 104466 Homo sapiens 902..1718 Rev
MBP-hnRNPA2_LC_R191K_R201K_R216K_R254K 104467 Homo sapiens 3852..4668 Rev
MBP-hnRNPA2_FL_P298L 104468 Homo sapiens 904..1720 Rev
hnRNPA2_LC_P298L_S285C 104469 Homo sapiens 903..1719 Rev
hnRNPA2_LC_P298L_S329C 104470 Homo sapiens 904..1720 Rev
TDP-43_NTD1-80_Y4R 104478 Homo sapiens 1885..2695 Fwd
TDP-43_NTD1-80_E17R 104479 Homo sapiens 1885..2695 Fwd
pJ4M/TDP-43 104480 Homo sapiens 2992..3802 Fwd
pJ4M/TDP-43 S48E 104481 Homo sapiens 2992..3802 Fwd
pCA528 CHMP1A 140-196 104593 Homo sapiens 558..1374 Rev
pCA528 CHMP2A 152-222 104594 Homo sapiens 558..1374 Rev
pCA528 CHMP2B 141-213 104595 Homo sapiens 558..1374 Rev
pCA528 CHMP4B 156-224 104596 Homo sapiens 558..1374 Rev
pCA528 CHMP6 145-201 104597 Homo sapiens 558..1374 Rev
pCA528 CHMP7 366-453 104598 Homo sapiens 558..1374 Rev
pCA528 CHMP3 159-222 104599 Homo sapiens 558..1374 Rev
LIC1B_Caspase-LOVN7C-7 C450A 104628 Homo sapiens 2307..3123 Rev
LIC1B_Caspase-LOVN7C-7 104629 Homo sapiens 2311..3127 Rev
pUG-124 104635 Arabidopsis thaliana 7490..8306 Rev
pUG-125 104636 Arabidopsis thaliana 7638..8454 Rev
pUG-153 104637 Arabidopsis thaliana 7003..7819 Rev
pUG-412 104638 Arabidopsis thaliana 9933..10749 Rev
pUG-413 104639 Arabidopsis thaliana 8698..9514 Rev
pUG-417 104640 Arabidopsis thaliana 9509..10325 Rev
pUG-293 104722 Arabidopsis thaliana 5264..6080 Rev
pUG-294 104723 Arabidopsis thaliana 6108..6924 Rev
pUG-296 104724 Arabidopsis thaliana 6593..7409 Rev
pUG-295 104725 Arabidopsis thaliana 6495..7311 Rev

DNA Sequence Variants

Sequence context may differ across plasmids due to position and neighboring features.

DNA Sequence (816 bp)
ATGAGCCATATTCAACGGGAAACGTCTTGCTCTAGGCCGCGATTAAATTCCAACATGGATGCTGATTTATATGGGTATAAATGGGCTCGCGATAATGTCGGGCAATCAGGTGCGACAATCTATCGATTGTATGGGAAGCCCGATGCGCCAGAGTTGTTTCTGAAACATGGCAAAGGTAGCGTTGCCAATGATGTTACAGATGAGATGGTCAGACTAAACTGGCTGACGGAATTTATGCCTCTTCCGACCATCAAGCATTTTATCCGTACTCCTGATGATGCATGGTTACTCACCACTGCGATCCCCGGGAAAACAGCATTCCAGGTATTAGAAGAATATCCTGATTCAGGTGAAAATATTGTTGATGCGCTGGCAGTGTTCCTGCGCCGGTTGCATTCGATTCCTGTTTGTAATTGTCCTTTTAACAGCGATCGCGTATTTCGTCTCGCTCAGGCGCAATCACGAATGAATAACGGTTTGGTTGATGCGAGTGATTTTGATGACGAGCGTAATGGCTGGCCTGTTGAACAAGTCTGGAAAGAAATGCATAAACTTTTGCCATTCTCACCGGATTCAGTCGTCACTCATGGTGATTTCTCACTTGATAACCTTATTTTTGACGAGGGGAAATTAATAGGTTGTATTGATGTTGGACGAGTCGGAATCGCAGACCGATACCAGGATCTTGCCATCCTATGGAACTGCCTCGGTGAGTTTTCTCCTTCATTACAGAAACGGCTTTTTCAAAAATATGGTATTGATAATCCTGATATGAATAAATTGCAGTTTCATTTGATGCTCGATGAGTTTTTCTAA
Protein Sequence (271 aa)
MSHIQRETSCSRPRLNSNMDADLYGYKWARDNVGQSGATIYRLYGKPDAPELFLKHGKGSVANDVTDEMVRLNWLTEFMPLPTIKHFIRTPDDAWLLTTAIPGKTAFQVLEEYPDSGENIVDALAVFLRRLHSIPVCNCPFNSDRVFRLAQAQSRMNNGLVDASDFDDERNGWPVEQVWKEMHKLLPFSPDSVVTHGDFSLDNLIFDEGKLIGCIDVGRVGIADRYQDLAILWNCLGEFSPSLQKRLFQKYGIDNPDMNKLQFHLMLDEFF
DNA Sequence (816 bp)
ATGAGCCATATTCAACGGGAAACGTCTTGCTCTAGGCCGCGATTAAATTCCAACATGGATGCTGATTTATATGGGTATAAATGGGCTCGCGATAATGTCGGGCAATCAGGTGCGACAATCTATCGATTGTATGGGAAGCCCGATGCGCCAGAGTTGTTTCTGAAACATGGCAAAGGTAGCGTTGCCAATGATGTTACAGATGAGATGGTCAGACTAAACTGGCTGACGGAATTTATGCCTCTTCCGACCATCAAGCATTTTATCCGTACTCCTGATGATGCATGGTTACTCACCACTGCGATCCCCGGGAAAACAGCATTCCAGGTATTAGAAGAATATCCTGATTCAGGTGAAAATATTGTTGATGCGCTGGCAGTGTTCCTGCGCCGGTTGCATTCGATTCCTGTTTGTAATTGTCCTTTTAACAGCGATCGCGTATTTCGTCTCGCTCAGGCGCAATCACGAATGAATAACGGTTTGGTTGATGCGAGTGATTTTGATGACGAGCGTAATGGCTGGCCTGTTGAACAAGTCTGGAAAGAAATGCATAAACTTTTGCCATTCTCACCGGATTCAGTCGTCACTCATGGTGATTTCTCACTTGATAACCTTATTTTTGACGAGGGGAAATTAATAGGTTGTATTGATGTTGGACGAGTCGGAATCGCAGACCGATACCAGGATCTTGCCATCCTATGGAACTGCCTCGGTGAGTTTTCTCCTTCATTACAGAAACGGCTTTTTCAAAAATATGGTATTGATAATCCTGATATGAATAAATTGCAGTTTCATTTGATGCTCGATGAGTTTTTCTAA
Protein Sequence (271 aa)
MSHIQRETSCSRPRLNSNMDADLYGYKWARDNVGQSGATIYRLYGKPDAPELFLKHGKGSVANDVTDEMVRLNWLTEFMPLPTIKHFIRTPDDAWLLTTAIPGKTAFQVLEEYPDSGENIVDALAVFLRRLHSIPVCNCPFNSDRVFRLAQAQSRMNNGLVDASDFDDERNGWPVEQVWKEMHKLLPFSPDSVVTHGDFSLDNLIFDEGKLIGCIDVGRVGIADRYQDLAILWNCLGEFSPSLQKRLFQKYGIDNPDMNKLQFHLMLDEFF
DNA Sequence (816 bp)
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Protein Sequence (271 aa)
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DNA Sequence (810 bp)
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DNA Sequence (810 bp)
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