| Label | Gene | Product | Position | Strand | |
|---|---|---|---|---|---|
| Rep101 | rep101 | RepA protein needed for replication wit… | 0..9235 | Rev | |
|
DNA Sequence
ATGTCTGAATTAGTTGTTTTCAAAGCAAATGAACTAGCGATTAGTCGCTATGACTTAACGGAGCATGAAACCAAGCTAATTTTATGCTGTGTGGCACTACTCAACCCCACGATTGAAAACCCTACAAGGAAAGAACGGACGGTATCGTTCACTTATAACCAATACGCTCAGATGATGAACATCAGTAGGGAAAATGCTTATGGTGTATTAGCTAAAGCAACCAGAGAGCTGATGACGAGAACTGTGGAAATCAGGAATCCTTTGGTTAAAGGCTTTGGGATTTTCCAGTGGACAAACTATGCCAAGTTCTCAAGCGAAAAATTAGAATTAGTTTTTAGTGAAGAGATATTGCCTTATCTTTTCCAGTTAAAAAAATTCATAAAATATAATCTGGAACATGTTAAGTCTTTTGAAAACAAATACTCTATGAGGATTTATGAGTGGTTATTAAAAGAACTAACACAAAAGAAAACTCACAAGGCAAATATAGAGATTAGCCTTGATGAATTTAAGTTCATGTTAATGCTTGAAAATAACTACCATGAGTTTAAAAGGCTTAACCAATGGGTTTTGAAACCAATAAGTAAAGATTTAAACACTTACAGCAATATGAAATTGGTGGTTGATAAGCGAGGCCGCCCGACTGATACGTTGATTTTCCAAGTTGAACTAGATAGACAAATGGATCTCGTAACCGAACTTGAGAACAACCAGATAAAAATGAATGGTGACAAAATACCAACAACCATTACATCAGATTCCTACCTACATAACGGACTAAGAAAAACACTACACGATGCTTTAACTGCAAAAATTCAGCTCACCAGTTTTGAGGCAAAATTTTTGAGTGACATGCAAAGTAAGTATGATCTCAATGGTTCGTTCTCATGGCTCACGCAAAAACAACGAACCACACTAGAGAACATACTGGCTAAATACGGAAGGATCTGA
Protein Sequence
MSELVVFKANELAISRYDLTEHETKLILCCVALLNPTIENPTRKERTVSFTYNQYAQMMNISRENAYGVLAKATRELMTRTVEIRNPLVKGFGIFQWTNYAKFSSEKLELVFSEEILPYLFQLKKFIKYNLEHVKSFENKYSMRIYEWLLKELTQKKTHKANIEISLDEFKFMLMLENNYHEFKRLNQWVLKPISKDLNTYSNMKLVVDKRGRPTDTLIFQVELDRQMDLVTELENNQIKMNGDKIPTTITSDSYLHNGLRKTLHDALTAKIQLTSFEAKFLSDMQSKYDLNGSFSWLTQKQRTTLENILAKYGRI
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| M13 gene II | II | pII | 1920..3153 | Fwd | |
|
DNA Sequence
ATGATTGACATGCTAGTTTTACGATTACCGTTCATCGATTCTCTTGTTTGCTCCAGACTCTCAGGCAATGACCTGATAGCCTTTGTAGACCTCTCAAAAATAGCTACCCTCTCCGGCATGAATTTATCAGCTAGAACGGTTGAATATCATATTGATGGTGATTTGACTGTCTCCGGCCTTTCTCACCCTTTTGAATCTTTACCTACACATTACTCAGGCATTGCATTTAAAATATATGAGGGTTCTAAAAATTTTTATCCTTGCGTTGAAATAAAGGCTTCTCCCGCAAAAGTATTACAGGGTCATAATGTTTTTGGTACAACCGATTTAGCTTTATGCTCTGAGGCTTTATTGCTTAATTTTGCTAATTCTTTGCCTTGCCTGTATGATTTATTGGATGTTAACGCTACTACTATTAGTAGAATTGATGCCACCTTTTCAGCTCGCGCCCCAAATGAAAATATAGCTAAACAGGTTATTGACCATTTGCGAAATGTATCTAATGGTCAAACTAAATCTACTCGTTCGCAGAATTGGGAATCAACTGTTACATGGAATGAAACTTCCAGACACCGTACTTTAGTTGCATATTTAAAACATGTTGAGCTACAGCACCAGATTCAGCAATTAAGCTCTAAGCCATCCGCAAAAATGACCTCTTATCAAAAGGAGCAATTAAAGGTACTCTCTAATCCTGACCTGTTGGAGTTTGCTTCCGGTCTGGTTCGCTTTGAAGCTCGAATTAAAACGCGATATTTGAAGTCTTTCGGGCTTCCTCTTAATCTTTTTGATGCAATCCGCTTTGCTTCTGACTATAATAGTCAGGGTAAAGACCTGATTTTTGATTTATGGTCATTCTCGTTTTCTGAACTGTTTAAAGCATTTGAGGGGGATTCAATGAATATTTATGACGATTCCGCAGTATTGGACGCTATCCAGTCTAAACATTTTACTATTACCCCCTCTGGCAAAACTTCTTTTGCAAAAGCCTCTCGCTATTTTGGTTTTTATCGTCGTCTGGTAAACGAGGGTTATGATAGTGTTGCTCTTACTATGCCTCGTAATTCCTTTTGGCGTTATGTATCTGCATTAGTTGAATGTGGTATTCCTAAATCTCAACTGATGAATCTTTCTACCTGTAATAATGTTGTTCCGTTAGTTCGTTTTATTAACGTAGATTTTTCTTCCCAACGTCCTGACTGGTATAATGAGCCAGTTCTTAAAATCGCATAA
Protein Sequence
MIDMLVLRLPFIDSLVCSRLSGNDLIAFVDLSKIATLSGMNLSARTVEYHIDGDLTVSGLSHPFESLPTHYSGIAFKIYEGSKNFYPCVEIKASPAKVLQGHNVFGTTDLALCSEALLLNFANSLPCLYDLLDVNATTISRIDATFSARAPNENIAKQVIDHLRNVSNGQTKSTRSQNWESTVTWNETSRHRTLVAYLKHVELQHQIQQLSSKPSAKMTSYQKEQLKVLSNPDLLEFASGLVRFEARIKTRYLKSFGLPLNLFDAIRFASDYNSQGKDLIFDLWSFSFSELFKAFEGDSMNIYDDSAVLDAIQSKHFTITPSGKTSFAKASRYFGFYRRLVNEGYDSVALTMPRNSFWRYVSALVECGIPKSQLMNLSTCNNVVPLVRFINVDFSSQRPDWYNEPVLKIA
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| M13 gene V | V | pV | 3164..3428 | Fwd | |
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DNA Sequence
ATGATTAAAGTTGAAATTAAACCATCTCAAGCCCAATTTACTACTCGTTCTGGTGTTTCTCGTCAGGGCAAGCCTTATTCACTGAATGAGCAGCTTTGTTACGTTGATTTGGGTAATGAATATCCGGTTCTTGTCAAGATTACTCTTGATGAAGGTCAGCCAGCCTATGCGCCTGGTCTGTACACCGTTCATCTGTCCTCTTTCAAAGTTGGTCAGTTCGGTTCCCTTATGATTGACCGTCTGCGCCTCGTTCCGGCTAAGTAA
Protein Sequence
MIKVEIKPSQAQFTTRSGVSRQGKPYSLNEQLCYVDLGNEYPVLVKITLDEGQPAYAPGLYTVHLSSFKVGQFGSLMIDRLRLVPAK
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| M13 gene VII | VII | pVII | 3429..3531 | Fwd | |
|
DNA Sequence
ATGGAGCAGGTCGCGGATTTCGACACAATTTATCAGGCGATGATACAAATCTCCGTTGTACTTTGTTTCGCGCTTGGTATAATCGCTGGGGGTCAAAGATGA
Protein Sequence
MEQVADFDTIYQAMIQISVVLCFALGIIAGGQR
|
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| M13 gene IX | IX | pIX | 3527..3626 | Fwd | |
|
DNA Sequence
ATGAGTGTTTTAGTGTATTCTTTCGCCTCTTTCGTTTTAGGTTGGTGCCTTCGTAGTGGCATTACGTATTTTACCCGTTTAATGGAAACTTCCTCATGA
Protein Sequence
MSVLVYSFASFVLGWCLRSGITYFTRLMETSS
|
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| M13 gene III | III | pIII | 3687..4962 | Fwd | |
|
DNA Sequence
GTGAAAAAATTATTATTCGCAATTCCTTTAGTTGTTCCTTTCTATTCTCACTCCGCTGAAACTGTTGAAAGTTGTTTAGCAAAACCCCATACAGAAAATTCATTTACTAACGTCTGGAAAGACGACAAAACTTTAGATCGTTACGCTAACTATGAGGGCTGTCTGTGGAATGCTACAGGCGTTGTAGTTTGTACTGGTGACGAAACTCAGTGTTACGGTACATGGGTTCCTATTGGGCTTGCTATCCCTGAAAATGAGGGTGGTGGCTCTGAGGGTGGCGGTTCTGAGGGTGGCGGTTCTGAGGGTGGCGGTACTAAACCTCCTGAGTACGGTGATACACCTATTCCGGGCTATACTTATATCAACCCTCTCGACGGCACTTATCCGCCTGGTACTGAGCAAAACCCCGCTAATCCTAATCCTTCTCTTGAGGAGTCTCAGCCTCTTAATACTTTCATGTTTCAGAATAATAGGTTCCGAAATAGGCAGGGGGCATTAACTGTTTATACGGGCACTGTTACTCAAGGCACTGACCCCGTTAAAACTTATTACCAGTACACTCCTGTATCATCAAAAGCCATGTATGACGCTTACTGGAACGGTAAATTCAGAGACTGCGCTTTCCATTCTGGCTTTAATGAGGATCCATTCGTTTGTGAATATCAAGGCCAATCGTCTGACCTGCCTCAACCTCCTGTCAATGCTGGCGGCGGCTCTGGTGGTGGTTCTGGTGGCGGCTCTGAGGGTGGTGGCTCTGAGGGTGGCGGTTCTGAGGGTGGCGGCTCTGAGGGAGGCGGTTCCGGTGGTGGCTCTGGTTCCGGTGATTTTGATTATGAAAAGATGGCAAACGCTAATAAGGGGGCTATGACCGAAAATGTCGATGAAAACGCGCTACAGTCTGACGCTAAAGGCAAACTTGATTCTGTCGCTACTGATTACGGTGCTGCTATCGATGGTTTCATTGGTGACGTTTCCGGCCTTGCTAATGGTAATGGTGCTACTGGTGATTTTGCTGGCTCTAATTCCCAAATGGCTCAAGTCGGTGACGGTGATAATTCACCTTTAATGAATAATTTCCGTCAATATTTACCTTCCCTCCCTCAATCGGTTGAATGTCGCCCTTTTGTCTTTGGCGCTGGTAAACCATATGAATTTTCTATTGATTGTGACAAAATAAACTTATTCCGTGGTGTCTTTGCGTTTCTTTTATATGTTGCCACCTTTATGTATGTATTTTCTACGTTTGCTAACATACTGCGTAATAAGGAGTCTTAA
Protein Sequence
MKKLLFAIPLVVPFYSHSAETVESCLAKPHTENSFTNVWKDDKTLDRYANYEGCLWNATGVVVCTGDETQCYGTWVPIGLAIPENEGGGSEGGGSEGGGSEGGGTKPPEYGDTPIPGYTYINPLDGTYPPGTEQNPANPNPSLEESQPLNTFMFQNNRFRNRQGALTVYTGTVTQGTDPVKTYYQYTPVSSKAMYDAYWNGKFRDCAFHSGFNEDPFVCEYQGQSSDLPQPPVNAGGGSGGGSGGGSEGGGSEGGGSEGGGSEGGGSGGGSGSGDFDYEKMANANKGAMTENVDENALQSDAKGKLDSVATDYGAAIDGFIGDVSGLANGNGATGDFAGSNSQMAQVGDGDNSPLMNNFRQYLPSLPQSVECRPFVFGAGKPYEFSIDCDKINLFRGVFAFLLYVATFMYVFSTFANILRNKES
|
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| M13 gene VI | VI | pVI | 4964..5303 | Fwd | |
|
DNA Sequence
ATGCCAGTTCTTTTGGGTATTCCGTTATTATTGCGTTTCCTCGGTTTCCTTCTGGTAACTTTGTTCGGCTATCTGCTTACTTTTCTTAAAAAGGGCTTCGGTAAGATAGCTATTGCTATTTCATTGTTTCTTGCTCTTATTATTGGGCTTAACTCAATTCTTGTGGGTTATCTCTCTGATATTAGCGCTCAATTACCCTCTGACTTTGTTCAGGGTGTTCAGTTAATTCTCCCGTCTAATGCGCTTCCCTGTTTTTATGTTATTCTCTCTGTAAAGGCTGCTATTTTCATTTTTGACGTTAAACAAAAAATCGTTTCTTATTTGGATTGGGATAAATAA
Protein Sequence
MPVLLGIPLLLRFLGFLLVTLFGYLLTFLKKGFGKIAIAISLFLALIIGLNSILVGYLSDISAQLPSDFVQGVQLILPSNALPCFYVILSVKAAIFIFDVKQKIVSYLDWDK
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| M13 gene I | I | pI | 5304..6351 | Fwd | |
|
DNA Sequence
ATGGCTGTTTATTTTGTAACTGGCAAATTAGGCTCTGGAAAGACGCTCGTTAGCGTTGGTAAGATTCAGGATAAAATTGTAGCTGGGTGCAAAATAGCAACTAATCTTGATTTAAGGCTTCAAAACCTCCCGCAAGTCGGGAGGTTCGCTAAAACGCCTCGCGTTCTTAGAATACCGGATAAGCCTTCTATATCTGATTTGCTTGCTATTGGGCGCGGTAATGATTCCTACGATGAAAATAAAAACGGCTTGCTTGTTCTCGATGAGTGCGGTACTTGGTTTAATACCCGTTCTTGGAATGATAAGGAAAGACAGCCGATTATTGATTGGTTTCTACATGCTCGTAAATTAGGATGGGATATTATTTTTCTTGTTCAGGACTTATCTATTGTTGATAAACAGGCGCGTTCTGCATTAGCTGAACATGTTGTTTATTGTCGTCGTCTGGACAGAATTACTTTACCTTTTGTCGGTACTTTATATTCTCTTATTACTGGCTCGAAAATGCCTCTGCCTAAATTACATGTTGGCGTTGTTAAATATGGCGATTCTCAATTAAGCCCTACTGTTGAGCGTTGGCTTTATACTGGTAAGAATTTGTATAACGCATATGATACTAAACAGGCTTTTTCTAGTAATTATGATTCCGGTGTTTATTCTTATTTAACGCCTTATTTATCACACGGTCGGTATTTCAAACCATTAAATTTAGGTCAGAAGATGAAATTAACTAAAATATATTTGAAAAAGTTTTCTCGCGTTCTTTGTCTTGCGATTGGATTTGCATCAGCATTTACATATAGTTATATAACCCAACCTAAGCCGGAGGTTAAAAAGGTAGTCTCTCAGACCTATGATTTTGATAAATTCACTATTGACTCTTCTCAGCGTCTTAATCTAAGCTATCGCTATGTTTTCAAGGATTCTAAGGGAAAATTAATTAATAGCGACGATTTACAGAAGCAAGGTTATTCACTCACATATATTGATTTATGTACTGTTTCCATTAAAAAAGGTAATTCAAATGAAATTGTTAAATGTAATTAA
Protein Sequence
MAVYFVTGKLGSGKTLVSVGKIQDKIVAGCKIATNLDLRLQNLPQVGRFAKTPRVLRIPDKPSISDLLAIGRGNDSYDENKNGLLVLDECGTWFNTRSWNDKERQPIIDWFLHARKLGWDIIFLVQDLSIVDKQARSALAEHVVYCRRLDRITLPFVGTLYSLITGSKMPLPKLHVGVVKYGDSQLSPTVERWLYTGKNLYNAYDTKQAFSSNYDSGVYSYLTPYLSHGRYFKPLNLGQKMKLTKIYLKKFSRVLCLAIGFASAFTYSYITQPKPEVKKVVSQTYDFDKFTIDSSQRLNLSYRYVFKDSKGKLINSDDLQKQGYSLTYIDLCTVSIKKGNSNEIVKCN
|
|||||
| M13 gene IV | IV | pIV | 6328..7609 | Fwd | |
|
DNA Sequence
ATGAAATTGTTAAATGTAATTAATTTTGTTTTCTTGATGTTTGTTTCATCATCTTCTTTTGCTCAGGTAATTGAAATGAATAATTCGCCTCTGCGCGATTTTGTAACTTGGTATTCAAAGCAATCAGGCGAATCCGTTATTGTTTCTCCCGATGTAAAAGGTACTGTTACTGTATATTCATCTGACGTTAAACCTGAAAATCTACGCAATTTCTTTATTTCTGTTTTACGTGCAAATAATTTTGATATGGTAGGTTCTAACCCTTCCATTATTCAGAAGTATAATCCAAACAATCAGGATTATATTGATGAATTGCCATCATCTGATAATCAGGAATATGATGATAATTCCGCTCCTTCTGGTGGTTTCTTTGTTCCGCAAAATGATAATGTTACTCAAACTTTTAAAATTAATAACGTTCGGGCAAAGGATTTAATACGAGTTGTCGAATTGTTTGTAAAGTCTAATACTTCTAAATCCTCAAATGTATTATCTATTGACGGCTCTAATCTATTAGTTGTTAGTGCTCCTAAAGATATTTTAGATAACCTTCCTCAATTCCTTTCAACTGTTGATTTGCCAACTGACCAGATATTGATTGAGGGTTTGATATTTGAGGTTCAGCAAGGTGATGCTTTAGATTTTTCATTTGCTGCTGGCTCTCAGCGTGGCACTGTTGCAGGCGGTGTTAATACTGACCGCCTCACCTCTGTTTTATCTTCTGCTGGTGGTTCGTTCGGTATTTTTAATGGCGATGTTTTAGGGCTATCAGTTCGCGCATTAAAGACTAATAGCCATTCAAAAATATTGTCTGTGCCACGTATTCTTACGCTTTCAGGTCAGAAGGGTTCTATCTCTGTTGGCCAGAATGTCCCTTTTATTACTGGTCGTGTGACTGGTGAATCTGCCAATGTAAATAATCCATTTCAGACGATTGAGCGTCAAAATGTAGGTATTTCCATGAGCGTTTTTCCTGTTGCAATGGCTGGCGGTAATATTGTTCTGGATATTACCAGCAAGGCCGATAGTTTGAGTTCTTCTACTCAGGCAAGTGATGTTATTACTAATCAAAGAAGTATTGCTACAACGGTTAATTTGCGTGATGGACAGACTCTTTTACTCGGTGGCCTCACTGATTATAAAAACACTTCTCAGGATTCTGGCGTACCGTTCCTGTCTAAAATCCCTTTAATCGGCCTCCTGTTTAGCTCCCGCTCTGATTCTAACGAGGAAAGCACGTTATACGTGCTCGTCAAAGCAACCATAGTACGCGCCCTGTAG
Protein Sequence
MKLLNVINFVFLMFVSSSSFAQVIEMNNSPLRDFVTWYSKQSGESVIVSPDVKGTVTVYSSDVKPENLRNFFISVLRANNFDMVGSNPSIIQKYNPNNQDYIDELPSSDNQEYDDNSAPSGGFFVPQNDNVTQTFKINNVRAKDLIRVVELFVKSNTSKSSNVLSIDGSNLLVVSAPKDILDNLPQFLSTVDLPTDQILIEGLIFEVQQGDALDFSFAAGSQRGTVAGGVNTDRLTSVLSSAGGSFGIFNGDVLGLSVRALKTNSHSKILSVPRILTLSGQKGSISVGQNVPFITGRVTGESANVNNPFQTIERQNVGISMSVFPVAMAGGNIVLDITSKADSLSSSTQASDVITNQRSIATTVNLRDGQTLLLGGLTDYKNTSQDSGVPFLSKIPLIGLLFSSRSDSNEESTLYVLVKATIVRAL
|
|||||
| KanR | aph(3')-Ia | aminoglycoside phosphotransferase | 7781..8597 | Rev | |
|
DNA Sequence
ATGAGCCATATTCAACGGGAAACGTCTTGCTCCCGTCCGCGCTTAAACTCCAACATGGACGCTGATTTATATGGGTATAAATGGGCTCGCGATAATGTCGGGCAATCAGGTGCGACAATCTATCGCTTGTATGGGAAGCCCGATGCGCCAGAGTTGTTTCTGAAACATGGCAAAGGTAGCGTTGCCAATGATGTTACAGATGAGATGGTCCGTCTCAACTGGCTGACGGAGTTTATGCCTCTCCCGACCATCAAGCATTTTATCCGTACTCCTGATGATGCGTGGTTACTCACCACCGCGATTCCTGGGAAAACAGCCTTCCAGGTATTAGAAGAATATCCTGATTCAGGTGAAAATATTGTTGATGCGCTGGCCGTGTTCCTGCGCCGGTTACATTCGATTCCTGTTTGTAATTGTCCTTTTAACAGCGATCGTGTATTTCGTCTTGCTCAGGCGCAATCACGCATGAATAACGGTTTGGTTGATGCGAGTGATTTTGATGACGAGCGTAATGGCTGGCCTGTTGAACAAGTCTGGAAAGAAATGCACAAGCTCTTGCCATTCTCACCGGATTCAGTCGTCACTCATGGTGATTTCTCACTTGATAACCTTATTTTTGACGAGGGGAAATTAATAGGTTGTATTGATGTTGGACGGGTCGGAATCGCAGACCGTTACCAGGACCTTGCCATTCTTTGGAACTGCCTCGGTGAGTTTTCTCCTTCATTACAGAAACGGCTTTTTCAAAAATATGGTATTGATAATCCTGATATGAATAAATTGCAGTTTCATTTGATGCTCGATGAGTTTTTCTAA
Protein Sequence
MSHIQRETSCSRPRLNSNMDADLYGYKWARDNVGQSGATIYRLYGKPDAPELFLKHGKGSVANDVTDEMVRLNWLTEFMPLPTIKHFIRTPDDAWLLTTAIPGKTAFQVLEEYPDSGENIVDALAVFLRRLHSIPVCNCPFNSDRVFRLAQAQSRMNNGLVDASDFDDERNGWPVEQVWKEMHKLLPFSPDSVVTHGDFSLDNLIFDEGKLIGCIDVGRVGIADRYQDLAILWNCLGEFSPSLQKRLFQKYGIDNPDMNKLQFHLMLDEFF
|
|||||
| Label | Gene | Product | Position | Strand | |
|---|---|---|---|---|---|
| pSC101 ori | — | — | 717..939 | Fwd | |
|
DNA Sequence
GGGCTAGTCAATGATAATTACATGTCCTTTTCCTTTGAGTTGTGGGTATCTGTAAATTCTGCTAGACCTTTGCTGGAAAACTTGTAAATTCTGCTAGACCCTCTGTAAATTCCGCTAGACCTTTGTGTGTTTTTTTGTTTATATTCAAGTGGTTATAATTTATAGAATAAAGAAAGAATAAAAAAAGATAAAAAGAATAGATCCCAGCCCTGTGTATAACTC
|
|||||
| Label | Gene | Product | Position | Strand | |
|---|---|---|---|---|---|
| lambda t0 terminator | — | — | 1430..1525 | Rev | |
|
DNA Sequence
GACTCCTGTTGATAGATCCAGTAATGACCTCAGAACTCCATCTGGATTTGTTCAGAACGCTCGGTTGCCGCCGGGCGTTTTTTATTGGTGAGAAT
|
|||||
| T3Te terminator | — | — | 1680..1710 | Rev | |
|
DNA Sequence
GGCTCACCTTCACGGGTGGGCCTTTCTTCG
|
|||||
| fd terminator | — | — | 3634..3683 | Fwd | |
|
DNA Sequence
ACCGATACAATTAAAGGCTCCTTTTGGAGCCTTTTTTTTTGGAGATTTT
|
|||||
| tonB terminator | — | — | 7651..7683 | Fwd | |
|
DNA Sequence
AGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACT
|
|||||