pBSV2H_Psyn-sgRNArodA

149569 Synthetic Bacterial Expression

Plasmid Information

Purpose
rodA gRNA expression in B. burgdorferi
Depositor
Christine Jacobs-Wagner
Article
Takacs et al Appl Environ Microbiol. 2020 Nov 30. pii
Insert
sgRNArodA
Promoter
Psyn
Available Since
Nov. 30, 2020
Availability
Available

Sequence Information

Length
8,837 bp
Topology
circular
Molecule Type
other DNA
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Features

CDS 2
Label Gene Product Position Strand
HygR aph(4)-Ia aminoglycoside phosphotransferase from … 5682..6702 Fwd
DNA Sequence
AAACCTGAATTAACTGCTACTAGTGTTGAAAAATTTTTAATTGAAAAATTTGATAGTGTTAGTGATTTAATGCAATTAAGTGAAGGTGAAGAAAGTAGAGCTTTTAGTTTTGATGTTGGTGGTAGAGGTTATGTTTTAAGAGTTAATAGTTGTGCTGATGGTTTTTATAAAGATAGATATGTTTATAGACATTTTGCTAGTGCTGCTTTACCTATTCCTGAAGTTTTAGATATTGGTGAATTTAGTGAAAGTTTAACTTATTGTATTAGTAGAAGAGCACAAGGTGTTACTTTACAAGATTTACCTGAAACTGAATTACCTGCTGTTTTACAACCTGTTGCTGAAGCTATGGATGCTATTGCGGCGGCTGATCTCAGTCAAACTTCGGGTTTTGGTCCTTTTGGTCCTCAAGGTATTGGTCAATATACTACTTGGAGAGATTTTATTTGTGCTATTGCTGATCCTCATGTTTATCATTGGCAAACTGTTATGGATGATACTGTTAGTGCTAGTGTTGCTCAAGCATTAGATGAATTAATGTTATGGGCTGAAGATTGTCCTGAAGTTAGACATTTAGTTCATGCTGATTTTGGTAGTAATAATGTTTTAACTGATAATGGTAGAATTACTGCTGTTATTGATTGGAGTGAAGCTATGTTTGGTGATAGTCAATATGAAGTTGCTAATATTTTTTTTTGGAGACCTTGGTTAGCTTGTATGGAACAACAAACTAGATATTTTGAAAGAAGACATCCTGAATTAGCTGGTAGTCCTAGATTAAGAGCTTATATGTTAAGAATTGGTTTAGATCAATTATATCAAAGTTTAGTTGATGGTAATTTTGATGATGCTGCTTGGGCTCAAGGTAGATGTGATGCTATTGTTAGAAGTGGTGCTGGTACTGTTGGTAGAACTCAAATTGCTAGAAGAAGTGCTGCTGTTTGGACTGATGGTTGTGTTGAAGTTTTAGCTGATAGTGGTAATAGAAGACCTAGTACTAGACCTAGAGCTAAAGAATAA
Protein Sequence
KPELTATSVEKFLIEKFDSVSDLMQLSEGEESRAFSFDVGGRGYVLRVNSCADGFYKDRYVYRHFASAALPIPEVLDIGEFSESLTYCISRRAQGVTLQDLPETELPAVLQPVAEAMDAIAAADLSQTSGFGPFGPQGIGQYTTWRDFICAIADPHVYHWQTVMDDTVSASVAQALDELMLWAEDCPEVRHLVHADFGSNNVLTDNGRITAVIDWSEAMFGDSQYEVANIFFWRPWLACMEQQTRYFERRHPELAGSPRLRAYMLRIGLDQLYQSLVDGNFDDAAWAQGRCDAIVRSGAGTVGRTQIARRSAAVWTDGCVEVLADSGNRRPSTRPRAKE
HygR aph(4)-Ia aminoglycoside phosphotransferase from … 7785..8805 Fwd
DNA Sequence
AAACCTGAATTAACTGCTACTAGTGTTGAAAAATTTTTAATTGAAAAATTTGATAGTGTTAGTGATTTAATGCAATTAAGTGAAGGTGAAGAAAGTAGAGCTTTTAGTTTTGATGTTGGTGGTAGAGGTTATGTTTTAAGAGTTAATAGTTGTGCTGATGGTTTTTATAAAGATAGATATGTTTATAGACATTTTGCTAGTGCTGCTTTACCTATTCCTGAAGTTTTAGATATTGGTGAATTTAGTGAAAGTTTAACTTATTGTATTAGTAGAAGAGCACAAGGTGTTACTTTACAAGATTTACCTGAAACTGAATTACCTGCTGTTTTACAACCTGTTGCTGAAGCTATGGATGCTATTGCGGCGGCTGATCTCAGTCAAACTTCGGGTTTTGGTCCTTTTGGTCCTCAAGGTATTGGTCAATATACTACTTGGAGAGATTTTATTTGTGCTATTGCTGATCCTCATGTTTATCATTGGCAAACTGTTATGGATGATACTGTTAGTGCTAGTGTTGCTCAAGCATTAGATGAATTAATGTTATGGGCTGAAGATTGTCCTGAAGTTAGACATTTAGTTCATGCTGATTTTGGTAGTAATAATGTTTTAACTGATAATGGTAGAATTACTGCTGTTATTGATTGGAGTGAAGCTATGTTTGGTGATAGTCAATATGAAGTTGCTAATATTTTTTTTTGGAGACCTTGGTTAGCTTGTATGGAACAACAAACTAGATATTTTGAAAGAAGACATCCTGAATTAGCTGGTAGTCCTAGATTAAGAGCTTATATGTTAAGAATTGGTTTAGATCAATTATATCAAAGTTTAGTTGATGGTAATTTTGATGATGCTGCTTGGGCTCAAGGTAGATGTGATGCTATTGTTAGAAGTGGTGCTGGTACTGTTGGTAGAACTCAAATTGCTAGAAGAAGTGCTGCTGTTTGGACTGATGGTTGTGTTGAAGTTTTAGCTGATAGTGGTAATAGAAGACCTAGTACTAGACCTAGAGCTAAAGAATAA
Protein Sequence
KPELTATSVEKFLIEKFDSVSDLMQLSEGEESRAFSFDVGGRGYVLRVNSCADGFYKDRYVYRHFASAALPIPEVLDIGEFSESLTYCISRRAQGVTLQDLPETELPAVLQPVAEAMDAIAAADLSQTSGFGPFGPQGIGQYTTWRDFICAIADPHVYHWQTVMDDTVSASVAQALDELMLWAEDCPEVRHLVHADFGSNNVLTDNGRITAVIDWSEAMFGDSQYEVANIFFWRPWLACMEQQTRYFERRHPELAGSPRLRAYMLRIGLDQLYQSLVDGNFDDAAWAQGRCDAIVRSGAGTVGRTQIARRSAAVWTDGCVEVLADSGNRRPSTRPRAKE
promoter 2
Label Gene Product Position Strand
lac promoter — — 4171..4202 Fwd
DNA Sequence
TTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTG
J23119(SpeI) promoter — — 4285..4320 Fwd
DNA Sequence
TTGACAGCTAGCTCAGTCCTAGGTATAATACTAGT
protein_bind 2
Label Gene Product Position Strand
CAP binding site — — 4135..4157 Fwd
DNA Sequence
TAATGTGAGTTAGCTCACTCAT
lac operator — — 4209..4226 Fwd
DNA Sequence
TTGTGAGCGGATAACAA
rep_origin 1
Label Gene Product Position Strand
ori — — 70..659 Fwd
DNA Sequence
TTGAGATCCTTTTTTTCTGCGCGTAATCTGCTGCTTGCAAACAAAAAAACCACCGCTACCAGCGGTGGTTTGTTTGCCGGATCAAGAGCTACCAACTCTTTTTCCGAAGGTAACTGGCTTCAGCAGAGCGCAGATACCAAATACTGTTCTTCTAGTGTAGCCGTAGTTAGGCCACCACTTCAAGAACTCTGTAGCACCGCCTACATACCTCGCTCTGCTAATCCTGTTACCAGTGGCTGCTGCCAGTGGCGATAAGTCGTGTCTTACCGGGTTGGACTCAAGACGATAGTTACCGGATAAGGCGCAGCGGTCGGGCTGAACGGGGGGTTCGTGCACACAGCCCAGCTTGGAGCGAACGACCTACACCGAACTGAGATACCTACAGCGTGAGCTATGAGAAAGCGCCACGCTTCCCGAAGGGAGAAAGGCGGACAGGTATCCGGTAAGCGGCAGGGTCGGAACAGGAGAGCGCACGAGGGAGCTTCCAGGGGGAAACGCCTGGTATCTTTATAGTCCTGTCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAA