pBSV2H_Psyn-sgRNAflaB

149561 Synthetic Bacterial Expression

Plasmid Information

Purpose
flaB gRNA expression in B. burgdorferi
Depositor
Christine Jacobs-Wagner
Article
Takacs et al Appl Environ Microbiol. 2020 Nov 30. pii
Insert
sgRNAflaB
Promoter
Psyn
Available Since
Jan. 7, 2021
Availability
Available

Sequence Information

Length
10,175 bp
Topology
circular
Molecule Type
other DNA

Features

CDS 2
Label Gene Product Position Strand
HygR aph(4)-Ia aminoglycoside phosphotransferase from … 4368..5388 Fwd
DNA Sequence
AAACCTGAATTAACTGCTACTAGTGTTGAAAAATTTTTAATTGAAAAATTTGATAGTGTTAGTGATTTAATGCAATTAAGTGAAGGTGAAGAAAGTAGAGCTTTTAGTTTTGATGTTGGTGGTAGAGGTTATGTTTTAAGAGTTAATAGTTGTGCTGATGGTTTTTATAAAGATAGATATGTTTATAGACATTTTGCTAGTGCTGCTTTACCTATTCCTGAAGTTTTAGATATTGGTGAATTTAGTGAAAGTTTAACTTATTGTATTAGTAGAAGAGCACAAGGTGTTACTTTACAAGATTTACCTGAAACTGAATTACCTGCTGTTTTACAACCTGTTGCTGAAGCTATGGATGCTATTGCGGCGGCTGATCTCAGTCAAACTTCGGGTTTTGGTCCTTTTGGTCCTCAAGGTATTGGTCAATATACTACTTGGAGAGATTTTATTTGTGCTATTGCTGATCCTCATGTTTATCATTGGCAAACTGTTATGGATGATACTGTTAGTGCTAGTGTTGCTCAAGCATTAGATGAATTAATGTTATGGGCTGAAGATTGTCCTGAAGTTAGACATTTAGTTCATGCTGATTTTGGTAGTAATAATGTTTTAACTGATAATGGTAGAATTACTGCTGTTATTGATTGGAGTGAAGCTATGTTTGGTGATAGTCAATATGAAGTTGCTAATATTTTTTTTTGGAGACCTTGGTTAGCTTGTATGGAACAACAAACTAGATATTTTGAAAGAAGACATCCTGAATTAGCTGGTAGTCCTAGATTAAGAGCTTATATGTTAAGAATTGGTTTAGATCAATTATATCAAAGTTTAGTTGATGGTAATTTTGATGATGCTGCTTGGGCTCAAGGTAGATGTGATGCTATTGTTAGAAGTGGTGCTGGTACTGTTGGTAGAACTCAAATTGCTAGAAGAAGTGCTGCTGTTTGGACTGATGGTTGTGTTGAAGTTTTAGCTGATAGTGGTAATAGAAGACCTAGTACTAGACCTAGAGCTAAAGAATAA
Protein Sequence
KPELTATSVEKFLIEKFDSVSDLMQLSEGEESRAFSFDVGGRGYVLRVNSCADGFYKDRYVYRHFASAALPIPEVLDIGEFSESLTYCISRRAQGVTLQDLPETELPAVLQPVAEAMDAIAAADLSQTSGFGPFGPQGIGQYTTWRDFICAIADPHVYHWQTVMDDTVSASVAQALDELMLWAEDCPEVRHLVHADFGSNNVLTDNGRITAVIDWSEAMFGDSQYEVANIFFWRPWLACMEQQTRYFERRHPELAGSPRLRAYMLRIGLDQLYQSLVDGNFDDAAWAQGRCDAIVRSGAGTVGRTQIARRSAAVWTDGCVEVLADSGNRRPSTRPRAKE
HygR aph(4)-Ia aminoglycoside phosphotransferase from … 6471..7491 Fwd
DNA Sequence
AAACCTGAATTAACTGCTACTAGTGTTGAAAAATTTTTAATTGAAAAATTTGATAGTGTTAGTGATTTAATGCAATTAAGTGAAGGTGAAGAAAGTAGAGCTTTTAGTTTTGATGTTGGTGGTAGAGGTTATGTTTTAAGAGTTAATAGTTGTGCTGATGGTTTTTATAAAGATAGATATGTTTATAGACATTTTGCTAGTGCTGCTTTACCTATTCCTGAAGTTTTAGATATTGGTGAATTTAGTGAAAGTTTAACTTATTGTATTAGTAGAAGAGCACAAGGTGTTACTTTACAAGATTTACCTGAAACTGAATTACCTGCTGTTTTACAACCTGTTGCTGAAGCTATGGATGCTATTGCGGCGGCTGATCTCAGTCAAACTTCGGGTTTTGGTCCTTTTGGTCCTCAAGGTATTGGTCAATATACTACTTGGAGAGATTTTATTTGTGCTATTGCTGATCCTCATGTTTATCATTGGCAAACTGTTATGGATGATACTGTTAGTGCTAGTGTTGCTCAAGCATTAGATGAATTAATGTTATGGGCTGAAGATTGTCCTGAAGTTAGACATTTAGTTCATGCTGATTTTGGTAGTAATAATGTTTTAACTGATAATGGTAGAATTACTGCTGTTATTGATTGGAGTGAAGCTATGTTTGGTGATAGTCAATATGAAGTTGCTAATATTTTTTTTTGGAGACCTTGGTTAGCTTGTATGGAACAACAAACTAGATATTTTGAAAGAAGACATCCTGAATTAGCTGGTAGTCCTAGATTAAGAGCTTATATGTTAAGAATTGGTTTAGATCAATTATATCAAAGTTTAGTTGATGGTAATTTTGATGATGCTGCTTGGGCTCAAGGTAGATGTGATGCTATTGTTAGAAGTGGTGCTGGTACTGTTGGTAGAACTCAAATTGCTAGAAGAAGTGCTGCTGTTTGGACTGATGGTTGTGTTGAAGTTTTAGCTGATAGTGGTAATAGAAGACCTAGTACTAGACCTAGAGCTAAAGAATAA
Protein Sequence
KPELTATSVEKFLIEKFDSVSDLMQLSEGEESRAFSFDVGGRGYVLRVNSCADGFYKDRYVYRHFASAALPIPEVLDIGEFSESLTYCISRRAQGVTLQDLPETELPAVLQPVAEAMDAIAAADLSQTSGFGPFGPQGIGQYTTWRDFICAIADPHVYHWQTVMDDTVSASVAQALDELMLWAEDCPEVRHLVHADFGSNNVLTDNGRITAVIDWSEAMFGDSQYEVANIFFWRPWLACMEQQTRYFERRHPELAGSPRLRAYMLRIGLDQLYQSLVDGNFDDAAWAQGRCDAIVRSGAGTVGRTQIARRSAAVWTDGCVEVLADSGNRRPSTRPRAKE
promoter 2
Label Gene Product Position Strand
lac promoter 1519..1550 Fwd
DNA Sequence
TTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTG
J23119(SpeI) promoter 1633..1668 Fwd
DNA Sequence
TTGACAGCTAGCTCAGTCCTAGGTATAATACTAGT
protein_bind 2
Label Gene Product Position Strand
CAP binding site 1483..1505 Fwd
DNA Sequence
TAATGTGAGTTAGCTCACTCAT
lac operator 1557..1574 Fwd
DNA Sequence
TTGTGAGCGGATAACAA
rep_origin 1
Label Gene Product Position Strand
ori 7593..8182 Fwd
DNA Sequence
TTGAGATCCTTTTTTTCTGCGCGTAATCTGCTGCTTGCAAACAAAAAAACCACCGCTACCAGCGGTGGTTTGTTTGCCGGATCAAGAGCTACCAACTCTTTTTCCGAAGGTAACTGGCTTCAGCAGAGCGCAGATACCAAATACTGTTCTTCTAGTGTAGCCGTAGTTAGGCCACCACTTCAAGAACTCTGTAGCACCGCCTACATACCTCGCTCTGCTAATCCTGTTACCAGTGGCTGCTGCCAGTGGCGATAAGTCGTGTCTTACCGGGTTGGACTCAAGACGATAGTTACCGGATAAGGCGCAGCGGTCGGGCTGAACGGGGGGTTCGTGCACACAGCCCAGCTTGGAGCGAACGACCTACACCGAACTGAGATACCTACAGCGTGAGCTATGAGAAAGCGCCACGCTTCCCGAAGGGAGAAAGGCGGACAGGTATCCGGTAAGCGGCAGGGTCGGAACAGGAGAGCGCACGAGGGAGCTTCCAGGGGGAAACGCCTGGTATCTTTATAGTCCTGTCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAA