sopB

CDS coding

Feature Information

Gene
sopB
Product
partitioning protein for the bacterial F plasmid
Type
CDS
Category
coding

Protein Sequence

323 amino acids
MKRAPVIPKHTLNTQPVEDTSLSTPAAPMVDSLIARVGVMARGNAITLPVCGRDVKFTLEVLRGDSVEKTSRVWSGNERDQELLTEDALDDLIPSFLLTGQQTPAFGRRVSGVIEIADGSRRRKAAALTESDYRVLVGELDDEQMAALSRLGNDYRPTSAYERGQRYASRLQNEFAGNISALADAENISRKIITRCINTAKLPKSVVALFSHPGELSARSGDALQKAFTDKEELLKQQASNLHEQKKAGVIFEAEEVITLLTSVLKTSSASRTSLSSRHQFAPGATVLYKGDKMVLNLDRSRVPTECIEKIEAILKELEKPAP

Found in 6 Plasmids

Plasmid Species Position Strand
pHyo182 173136 Synthetic 3800..4772 Rev
pHyo245 173147 Synthetic 9083..10055 Fwd
POC1546 226487 Homo sapiens 8115..9087 Fwd
POC1548 226490 Homo sapiens 6532..7504 Fwd
POC1549 226491 Homo sapiens 6885..7857 Fwd
POC1550 226497 Homo sapiens 6304..7276 Fwd

DNA Sequence Variants

Sequence context may differ across plasmids due to position and neighboring features.

DNA Sequence (972 bp)
ATGAAGCGTGCGCCTGTTATTCCAAAACATACGCTCAATACTCAACCGGTTGAAGATACTTCGTTATCGACACCAGCTGCCCCGATGGTGGATTCGTTAATTGCGCGCGTAGGAGTAATGGCTCGCGGTAATGCCATTACTTTGCCTGTATGTGGTCGGGATGTGAAGTTTACTCTTGAAGTGCTCCGGGGTGATAGTGTTGAGAAGACCTCTCGGGTATGGTCAGGTAATGAACGTGACCAGGAGCTGCTTACTGAGGACGCACTGGATGATCTCATCCCTTCTTTTCTACTGACTGGTCAACAGACACCGGCGTTCGGTCGAAGAGTATCTGGTGTCATAGAAATTGCCGATGGGAGTCGCCGTCGTAAAGCTGCTGCACTTACCGAAAGTGATTATCGTGTTCTGGTTGGCGAGCTGGATGATGAGCAGATGGCTGCATTATCCAGATTGGGTAACGATTATCGCCCAACAAGTGCTTATGAACGTGGTCAGCGTTATGCAAGCCGATTGCAGAATGAATTTGCTGGAAATATTTCTGCGCTGGCTGATGCGGAAAATATTTCACGTAAGATTATTACCCGCTGTATCAACACCGCCAAATTGCCTAAATCAGTTGTTGCTCTTTTTTCTCACCCCGGTGAACTATCTGCCCGGTCAGGTGATGCACTTCAAAAAGCCTTTACAGATAAAGAGGAATTACTTAAGCAGCAGGCATCTAACCTTCATGAGCAGAAAAAAGCTGGGGTGATATTTGAAGCTGAAGAAGTTATCACTCTTTTAACTTCTGTGCTTAAAACGTCATCTGCATCAAGAACTAGTTTAAGCTCACGACATCAGTTTGCTCCTGGAGCGACAGTATTGTATAAGGGCGATAAAATGGTGCTTAACCTGGACAGGTCTCGTGTTCCAACTGAGTGTATAGAGAAAATTGAGGCCATTCTTAAGGAACTTGAAAAGCCAGCACCCTGA
Protein Sequence (323 aa)
MKRAPVIPKHTLNTQPVEDTSLSTPAAPMVDSLIARVGVMARGNAITLPVCGRDVKFTLEVLRGDSVEKTSRVWSGNERDQELLTEDALDDLIPSFLLTGQQTPAFGRRVSGVIEIADGSRRRKAAALTESDYRVLVGELDDEQMAALSRLGNDYRPTSAYERGQRYASRLQNEFAGNISALADAENISRKIITRCINTAKLPKSVVALFSHPGELSARSGDALQKAFTDKEELLKQQASNLHEQKKAGVIFEAEEVITLLTSVLKTSSASRTSLSSRHQFAPGATVLYKGDKMVLNLDRSRVPTECIEKIEAILKELEKPAP
DNA Sequence (972 bp)
ATGAAGCGTGCGCCTGTTATTCCAAAACATACGCTCAATACTCAACCGGTTGAAGATACTTCGTTATCGACACCAGCTGCCCCGATGGTGGATTCGTTAATTGCGCGCGTAGGAGTAATGGCTCGCGGTAATGCCATTACTTTGCCTGTATGTGGTCGGGATGTGAAGTTTACTCTTGAAGTGCTCCGGGGTGATAGTGTTGAGAAGACCTCTCGGGTATGGTCAGGTAATGAACGTGACCAGGAGCTGCTTACTGAGGACGCACTGGATGATCTCATCCCTTCTTTTCTACTGACTGGTCAACAGACACCGGCGTTCGGTCGAAGAGTATCTGGTGTCATAGAAATTGCCGATGGGAGTCGCCGTCGTAAAGCTGCTGCACTTACCGAAAGTGATTATCGTGTTCTGGTTGGCGAGCTGGATGATGAGCAGATGGCTGCATTATCCAGATTGGGTAACGATTATCGCCCAACAAGTGCTTATGAACGTGGTCAGCGTTATGCAAGCCGATTGCAGAATGAATTTGCTGGAAATATTTCTGCGCTGGCTGATGCGGAAAATATTTCACGTAAGATTATTACCCGCTGTATCAACACCGCCAAATTGCCTAAATCAGTTGTTGCTCTTTTTTCTCACCCCGGTGAACTATCTGCCCGGTCAGGTGATGCACTTCAAAAAGCCTTTACAGATAAAGAGGAATTACTTAAGCAGCAGGCATCTAACCTTCATGAGCAGAAAAAAGCTGGGGTGATATTTGAAGCTGAAGAAGTTATCACTCTTTTAACTTCTGTGCTTAAAACGTCATCCGCATCAAGAACTAGTTTAAGCTCACGACATCAGTTTGCTCCTGGAGCGACAGTATTGTATAAGGGCGATAAAATGGTGCTTAACCTGGACAGGTCTCGTGTTCCAACTGAGTGTATAGAGAAAATTGAGGCCATTCTTAAGGAACTTGAAAAGCCAGCACCCTGA
Protein Sequence (323 aa)
MKRAPVIPKHTLNTQPVEDTSLSTPAAPMVDSLIARVGVMARGNAITLPVCGRDVKFTLEVLRGDSVEKTSRVWSGNERDQELLTEDALDDLIPSFLLTGQQTPAFGRRVSGVIEIADGSRRRKAAALTESDYRVLVGELDDEQMAALSRLGNDYRPTSAYERGQRYASRLQNEFAGNISALADAENISRKIITRCINTAKLPKSVVALFSHPGELSARSGDALQKAFTDKEELLKQQASNLHEQKKAGVIFEAEEVITLLTSVLKTSSASRTSLSSRHQFAPGATVLYKGDKMVLNLDRSRVPTECIEKIEAILKELEKPAP
DNA Sequence (972 bp)
ATGAAGCGTGCGCCTGTTATTCCAAAACATACGCTCAATACTCAACCGGTTGAAGATACTTCGTTATCGACACCAGCTGCCCCGATGGTGGATTCGTTAATTGCGCGCGTAGGAGTAATGGCTCGCGGTAATGCCATTACTTTGCCTGTATGTGGTCGGGATGTGAAGTTTACTCTTGAAGTGCTCCGGGGTGATAGTGTTGAGAAAACCTCTCGGGTATGGTCAGGTAATGAACGTGACCAGGAGCTGCTTACTGAGGACGCACTGGATGATCTCATCCCTTCTTTTCTACTGACTGGTCAACAGACACCGGCGTTCGGTCGAAGAGTATCTGGTGTCATAGAAATTGCCGATGGGAGTCGCCGTCGTAAAGCTGCTGCACTTACCGAAAGTGATTATCGTGTTCTGGTTGGCGAGCTGGATGATGAGCAGATGGCTGCATTATCCAGATTGGGTAACGATTATCGCCCAACAAGTGCTTATGAACGTGGTCAGCGTTATGCAAGCCGATTGCAGAATGAATTTGCTGGAAATATTTCTGCGCTGGCTGATGCGGAAAATATTTCACGTAAGATTATTACCCGCTGTATCAACACCGCCAAATTGCCTAAATCAGTTGTTGCTCTTTTTTCTCACCCCGGTGAACTATCTGCCCGGTCAGGTGATGCACTTCAAAAAGCCTTTACAGATAAAGAGGAATTACTTAAGCAGCAGGCATCTAACCTTCATGAGCAGAAAAAAGCTGGGGTGATATTTGAAGCTGAAGAAGTTATCACTCTTTTAACTTCTGTGCTTAAAACGTCATCTGCATCAAGAACTAGTTTAAGCTCACGACATCAGTTTGCTCCTGGAGCGACAGTATTGTATAAGGGCGATAAAATGGTGCTTAACCTGGACAGGTCACGTGTTCCAACTGAGTGTATAGAGAAAATTGAGGCCATTCTTAAGGAACTTGAAAAGCCAGCACCCTGA
Protein Sequence (323 aa)
MKRAPVIPKHTLNTQPVEDTSLSTPAAPMVDSLIARVGVMARGNAITLPVCGRDVKFTLEVLRGDSVEKTSRVWSGNERDQELLTEDALDDLIPSFLLTGQQTPAFGRRVSGVIEIADGSRRRKAAALTESDYRVLVGELDDEQMAALSRLGNDYRPTSAYERGQRYASRLQNEFAGNISALADAENISRKIITRCINTAKLPKSVVALFSHPGELSARSGDALQKAFTDKEELLKQQASNLHEQKKAGVIFEAEEVITLLTSVLKTSSASRTSLSSRHQFAPGATVLYKGDKMVLNLDRSRVPTECIEKIEAILKELEKPAP
DNA Sequence (972 bp)
ATGAAGCGTGCGCCTGTTATTCCAAAACATACGCTCAATACTCAACCGGTTGAAGATACTTCGTTATCGACACCAGCTGCCCCGATGGTGGATTCGTTAATTGCGCGCGTAGGAGTAATGGCTCGCGGTAATGCCATTACTTTGCCTGTATGTGGTCGGGATGTGAAGTTTACTCTTGAAGTGCTCCGGGGTGATAGTGTTGAGAAAACCTCTCGGGTATGGTCAGGTAATGAACGTGACCAGGAGCTGCTTACTGAGGACGCACTGGATGATCTCATCCCTTCTTTTCTACTGACTGGTCAACAGACACCGGCGTTCGGTCGAAGAGTATCTGGTGTCATAGAAATTGCCGATGGGAGTCGCCGTCGTAAAGCTGCTGCACTTACCGAAAGTGATTATCGTGTTCTGGTTGGCGAGCTGGATGATGAGCAGATGGCTGCATTATCCAGATTGGGTAACGATTATCGCCCAACAAGTGCTTATGAACGTGGTCAGCGTTATGCAAGCCGATTGCAGAATGAATTTGCTGGAAATATTTCTGCGCTGGCTGATGCGGAAAATATTTCACGTAAGATTATTACCCGCTGTATCAACACCGCCAAATTGCCTAAATCAGTTGTTGCTCTTTTTTCTCACCCCGGTGAACTATCTGCCCGGTCAGGTGATGCACTTCAAAAAGCCTTTACAGATAAAGAGGAATTACTTAAGCAGCAGGCATCTAACCTTCATGAGCAGAAAAAAGCTGGGGTGATATTTGAAGCTGAAGAAGTTATCACTCTTTTAACTTCTGTGCTTAAAACGTCATCTGCATCAAGAACTAGTTTAAGCTCACGACATCAGTTTGCTCCTGGAGCGACAGTATTGTATAAGGGCGATAAAATGGTGCTTAACCTGGACAGGTCACGTGTTCCAACTGAGTGTATAGAGAAAATTGAGGCCATTCTTAAGGAACTTGAAAAGCCAGCACCCTGA
Protein Sequence (323 aa)
MKRAPVIPKHTLNTQPVEDTSLSTPAAPMVDSLIARVGVMARGNAITLPVCGRDVKFTLEVLRGDSVEKTSRVWSGNERDQELLTEDALDDLIPSFLLTGQQTPAFGRRVSGVIEIADGSRRRKAAALTESDYRVLVGELDDEQMAALSRLGNDYRPTSAYERGQRYASRLQNEFAGNISALADAENISRKIITRCINTAKLPKSVVALFSHPGELSARSGDALQKAFTDKEELLKQQASNLHEQKKAGVIFEAEEVITLLTSVLKTSSASRTSLSSRHQFAPGATVLYKGDKMVLNLDRSRVPTECIEKIEAILKELEKPAP
DNA Sequence (972 bp)
ATGAAGCGTGCGCCTGTTATTCCAAAACATACGCTCAATACTCAACCGGTTGAAGATACTTCGTTATCGACACCAGCTGCCCCGATGGTGGATTCGTTAATTGCGCGCGTAGGAGTAATGGCTCGCGGTAATGCCATTACTTTGCCTGTATGTGGTCGGGATGTGAAGTTTACTCTTGAAGTGCTCCGGGGTGATAGTGTTGAGAAAACCTCTCGGGTATGGTCAGGTAATGAACGTGACCAGGAGCTGCTTACTGAGGACGCACTGGATGATCTCATCCCTTCTTTTCTACTGACTGGTCAACAGACACCGGCGTTCGGTCGAAGAGTATCTGGTGTCATAGAAATTGCCGATGGGAGTCGCCGTCGTAAAGCTGCTGCACTTACCGAAAGTGATTATCGTGTTCTGGTTGGCGAGCTGGATGATGAGCAGATGGCTGCATTATCCAGATTGGGTAACGATTATCGCCCAACAAGTGCTTATGAACGTGGTCAGCGTTATGCAAGCCGATTGCAGAATGAATTTGCTGGAAATATTTCTGCGCTGGCTGATGCGGAAAATATTTCACGTAAGATTATTACCCGCTGTATCAACACCGCCAAATTGCCTAAATCAGTTGTTGCTCTTTTTTCTCACCCCGGTGAACTATCTGCCCGGTCAGGTGATGCACTTCAAAAAGCCTTTACAGATAAAGAGGAATTACTTAAGCAGCAGGCATCTAACCTTCATGAGCAGAAAAAAGCTGGGGTGATATTTGAAGCTGAAGAAGTTATCACTCTTTTAACTTCTGTGCTTAAAACGTCATCTGCATCAAGAACTAGTTTAAGCTCACGACATCAGTTTGCTCCTGGAGCGACAGTATTGTATAAGGGCGATAAAATGGTGCTTAACCTGGACAGGTCACGTGTTCCAACTGAGTGTATAGAGAAAATTGAGGCCATTCTTAAGGAACTTGAAAAGCCAGCACCCTGA
Protein Sequence (323 aa)
MKRAPVIPKHTLNTQPVEDTSLSTPAAPMVDSLIARVGVMARGNAITLPVCGRDVKFTLEVLRGDSVEKTSRVWSGNERDQELLTEDALDDLIPSFLLTGQQTPAFGRRVSGVIEIADGSRRRKAAALTESDYRVLVGELDDEQMAALSRLGNDYRPTSAYERGQRYASRLQNEFAGNISALADAENISRKIITRCINTAKLPKSVVALFSHPGELSARSGDALQKAFTDKEELLKQQASNLHEQKKAGVIFEAEEVITLLTSVLKTSSASRTSLSSRHQFAPGATVLYKGDKMVLNLDRSRVPTECIEKIEAILKELEKPAP
DNA Sequence (972 bp)
ATGAAGCGTGCGCCTGTTATTCCAAAACATACGCTCAATACTCAACCGGTTGAAGATACTTCGTTATCGACACCAGCTGCCCCGATGGTGGATTCGTTAATTGCGCGCGTAGGAGTAATGGCTCGCGGTAATGCCATTACTTTGCCTGTATGTGGTCGGGATGTGAAGTTTACTCTTGAAGTGCTCCGGGGTGATAGTGTTGAGAAAACCTCTCGGGTATGGTCAGGTAATGAACGTGACCAGGAGCTGCTTACTGAGGACGCACTGGATGATCTCATCCCTTCTTTTCTACTGACTGGTCAACAGACACCGGCGTTCGGTCGAAGAGTATCTGGTGTCATAGAAATTGCCGATGGGAGTCGCCGTCGTAAAGCTGCTGCACTTACCGAAAGTGATTATCGTGTTCTGGTTGGCGAGCTGGATGATGAGCAGATGGCTGCATTATCCAGATTGGGTAACGATTATCGCCCAACAAGTGCTTATGAACGTGGTCAGCGTTATGCAAGCCGATTGCAGAATGAATTTGCTGGAAATATTTCTGCGCTGGCTGATGCGGAAAATATTTCACGTAAGATTATTACCCGCTGTATCAACACCGCCAAATTGCCTAAATCAGTTGTTGCTCTTTTTTCTCACCCCGGTGAACTATCTGCCCGGTCAGGTGATGCACTTCAAAAAGCCTTTACAGATAAAGAGGAATTACTTAAGCAGCAGGCATCTAACCTTCATGAGCAGAAAAAAGCTGGGGTGATATTTGAAGCTGAAGAAGTTATCACTCTTTTAACTTCTGTGCTTAAAACGTCATCTGCATCAAGAACTAGTTTAAGCTCACGACATCAGTTTGCTCCTGGAGCGACAGTATTGTATAAGGGCGATAAAATGGTGCTTAACCTGGACAGGTCACGTGTTCCAACTGAGTGTATAGAGAAAATTGAGGCCATTCTTAAGGAACTTGAAAAGCCAGCACCCTGA
Protein Sequence (323 aa)
MKRAPVIPKHTLNTQPVEDTSLSTPAAPMVDSLIARVGVMARGNAITLPVCGRDVKFTLEVLRGDSVEKTSRVWSGNERDQELLTEDALDDLIPSFLLTGQQTPAFGRRVSGVIEIADGSRRRKAAALTESDYRVLVGELDDEQMAALSRLGNDYRPTSAYERGQRYASRLQNEFAGNISALADAENISRKIITRCINTAKLPKSVVALFSHPGELSARSGDALQKAFTDKEELLKQQASNLHEQKKAGVIFEAEEVITLLTSVLKTSSASRTSLSSRHQFAPGATVLYKGDKMVLNLDRSRVPTECIEKIEAILKELEKPAP