KanR

CDS antibiotic_resistance

Feature Information

Gene
aph(3')-Ia
Product
aminoglycoside phosphotransferase
Note
confers resistance to kanamycin in bacteria or G418 (Geneticin(R)) in eukaryotes
Type
CDS
Category
antibiotic_resistance

Protein Sequence

271 amino acids
MSHIQRETSCSRPRLNSNMDADLYGYKWARDNVGQSGATIYRLYGKPDAPELFLKHGKGSVANDVTDEMVRLNWLTEFMPLPTIKHFIRTPDDAWLLTTAIPGKTAFQVLEEYPDSGENIVDALAVFLRRLHSIPVCNCPFNSDRVFRLAQAQSRMNKGLVDASDFDDERNGWPVEQVWKEMHKLLPFSPDSVVTHGDFSLDNLIFDEGKLIGCIDVGRVGIADRYQDLAILWNCLGEFSPSLQKRLFQKYGIDNPDMNKLQFHLMLDEFF

Found in 4,204 Plasmids (showing 3551–3600)

Plasmid Species Position Strand
pREC1010lac-Tsp1 240698 Synthetic 2380..3196 Fwd
pREC1010lac-Ebu1 240699 Synthetic 8434..9250 Rev
pREC1010lac-Hcl1 240700 Synthetic 838..1654 Fwd
pREC1010-opEas1 240701 Synthetic 1672..2488 Fwd
pREC1010-opEbu1 240702 Synthetic 1672..2488 Fwd
pRECMYC-Eco1 240705 Synthetic 7153..7969 Fwd
pRECMYC-Eco2 240706 Synthetic 3964..4780 Rev
pRECMYC-Ban1 240707 Synthetic 3747..4563 Fwd
pRECMYC-Abe1 240708 Synthetic 4825..5641 Rev
pRECMYC-Kva1 240709 Synthetic 5496..6312 Rev
pRECMYC-Eas1 240710 Synthetic 6586..7402 Fwd
pRECMYC-Csp1 240711 Synthetic 4549..5365 Fwd
pRECMYC-Tsp1 240712 Synthetic 0..9505 Rev
pRECMYC-Ebu1 240713 Synthetic 4845..5661 Rev
pRECMYC-Hcl1 240714 Synthetic 4944..5760 Rev
Sc [rad24 + RFC5]-pLANT/RIL 240732 Saccharomyces cerevisiae 4943..5759 Rev
Sc FLAG-rad24-pRSFDuet 240733 Saccharomyces cerevisiae 1179..1995 Fwd
Sc FLAG-S6-rad24-pRSFDuet 240734 Saccharomyces cerevisiae 2103..2919 Fwd
Sc FLAG-kin-mec3-pRSFDuet 240741 Saccharomyces cerevisiae 1739..2555 Fwd
pET-29_GSS-6xHis-SUMO-VidC-EGFP-FLAG 241009 Synthetic 2964..3780 Fwd
pET-29_GSS-6xHis-SUMO-VidC-mCherry-FLAG 241010 Synthetic 943..1759 Fwd
TDP43-NTD 241024 Homo sapiens 1885..2695 Fwd
pET-HA-MBP-CatN-TEV-CfaC-eGFP-FLAG 241423 Synthetic 6872..7688 Rev
pET-CatC-HA-CfaNm 241424 Synthetic 831..1647 Rev
PACE_SP_SD4_AraC 242143 Synthetic 1072..1888 Rev
PACE_SP_SD4_AraC_S170_LOV 242144 Synthetic 1762..2578 Rev
PACE_SP_SD4_AraC_R2_S170_LOV 242145 Synthetic 1762..2578 Rev
PACE_SP_SD4_AraC_R5_S170_LOV 242146 Synthetic 1762..2578 Rev
pJUMP27_pBAD_mRFP_LVA 242147 Synthetic 1555..2371 Fwd
MBP-Streptavidin-RGG 242451 Caenorhabditis elegans 4226..5042 Rev
MBP-GFP-RGG 242453 Caenorhabditis elegans 581..1397 Rev
GST-GFP-RGG 242454 Caenorhabditis elegans 581..1397 Rev
M20 242618 Homo sapiens 720..1536 Rev
M24 242619 Homo sapiens 1647..2463 Rev
M51 242620 Homo sapiens 720..1536 Rev
M53 242621 Homo sapiens 720..1536 Rev
M54 242622 Homo sapiens 720..1536 Rev
M55 242623 Homo sapiens 720..1536 Rev
M101 242624 Homo sapiens 2095..2911 Rev
TTR C10S/S85C/T119M 242712 Homo sapiens 4608..5424 Fwd
pFS551 242851 Schizosaccharomyces pombe 3772..4582 Rev
pFS552 242852 Schizosaccharomyces pombe 3783..4593 Rev
pFS553 242853 Schizosaccharomyces pombe 3785..4595 Rev
pFS554 242854 Schizosaccharomyces pombe 3879..4689 Rev
pFS555 242855 Schizosaccharomyces pombe 3789..4599 Rev
MBP-FUS-RGG3 243672 Homo sapiens 5079..5895 Fwd
pAWP78-PVCpnf_pvc13-Ad5_pvc10-Cas9 243733 Synthetic 338..1154 Rev
pAWP78-PVCpnf_pvc13-Truncated_pvc10-Cas9 243734 Synthetic 338..1154 Rev
pAWP78-PVCpnf_pvc13-Ad5_Cas9-Pvc10 243735 Synthetic 338..1154 Rev
pAWP78-PVCpnf_pvc13-Ad5_pvc8-Cas9 243737 Synthetic 337..1153 Rev

DNA Sequence Variants

Sequence context may differ across plasmids due to position and neighboring features.

DNA Sequence (816 bp)
ATGAGCCATATTCAGCGTGAAACGAGCTGTAGCCGTCCGCGTCTGAACAGCAACATGGATGCGGATCTGTATGGCTATAAATGGGCGCGTGATAACGTGGGTCAGAGCGGCGCGACCATTTATCGTCTGTATGGCAAACCGGATGCGCCGGAACTGTTTCTGAAACATGGCAAAGGCAGCGTGGCGAACGATGTGACCGATGAAATGGTGCGTCTGAACTGGCTGACCGAATTTATGCCGCTGCCGACCATTAAACATTTTATTCGCACCCCGGATGATGCGTGGCTGCTGACCACCGCGATTCCGGGCAAAACCGCGTTTCAGGTGCTGGAAGAATATCCGGATAGCGGCGAAAACATTGTGGATGCGCTGGCCGTGTTTCTGCGTCGTCTGCATAGCATTCCGGTGTGCAACTGCCCGTTTAACAGCGATCGTGTGTTTCGTCTGGCCCAGGCGCAGAGCCGTATGAACAACGGCCTGGTGGATGCGAGCGATTTTGATGATGAACGTAACGGCTGGCCGGTGGAACAGGTGTGGAAAGAAATGCATAAACTGCTGCCGTTTAGCCCGGATAGCGTGGTGACCCACGGCGATTTTAGCCTGGATAACCTGATTTTCGATGAAGGCAAACTGATTGGCTGCATTGATGTGGGCCGTGTGGGCATTGCGGATCGTTATCAGGATCTGGCCATTCTGTGGAACTGCCTGGGCGAATTTAGCCCGAGCCTGCAAAAACGTCTGTTTCAGAAATATGGCATTGATAATCCGGATATGAACAAACTGCAATTTCATCTGATGCTGGATGAATTTTTCTAA
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