KanR

CDS antibiotic_resistance

Feature Information

Gene
aph(3')-Ia
Product
aminoglycoside phosphotransferase
Note
confers resistance to kanamycin in bacteria or G418 (Geneticin(R)) in eukaryotes
Type
CDS
Category
antibiotic_resistance

Protein Sequence

271 amino acids
MSHIQRETSCSRPRLNSNMDADLYGYKWARDNVGQSGATIYRLYGKPDAPELFLKHGKGSVANDVTDEMVRLNWLTEFMPLPTIKHFIRTPDDAWLLTTAIPGKTAFQVLEEYPDSGENIVDALAVFLRRLHSIPVCNCPFNSDRVFRLAQAQSRMNKGLVDASDFDDERNGWPVEQVWKEMHKLLPFSPDSVVTHGDFSLDNLIFDEGKLIGCIDVGRVGIADRYQDLAILWNCLGEFSPSLQKRLFQKYGIDNPDMNKLQFHLMLDEFF

Found in 4,204 Plasmids (showing 301–350)

Plasmid Species Position Strand
p3E-Cltb 109586 Danio rerio 935..1745 Fwd
p3E-Pacsin2 109587 Danio rerio 1881..2691 Fwd
p3E-ARF1 109589 Danio rerio 951..1761 Fwd
p3E-ARF1-DN 109590 Danio rerio 851..1661 Fwd
p3E-ARF6 109591 Danio rerio 936..1746 Fwd
p3E-ARF6-DN 109592 Danio rerio 936..1746 Fwd
p3E-rab10 109661 Danio rerio 1028..1838 Fwd
p3E-rab11a 109662 Danio rerio 956..1766 Fwd
p3E-rab11al 109663 Danio rerio 1070..1880 Fwd
p3E-rab11ba 109664 Danio rerio 1072..1882 Fwd
p3E-rab11bb 109665 Danio rerio 976..1786 Fwd
p3E-rab12 109666 Danio rerio 1016..1826 Fwd
p3E-rab13 109667 Danio rerio 911..1721 Fwd
p3E-rab14 109668 Danio rerio 1056..1866 Fwd
p3E-rab14l 109669 Danio rerio 962..1772 Fwd
p3E-rab15 109670 Danio rerio 1047..1857 Fwd
p3E-rab18a 109671 Danio rerio 1026..1836 Fwd
p3E-rab18b 109672 Danio rerio 1036..1846 Fwd
p3E-rab1aa 109673 Danio rerio 2245..3055 Rev
p3E-rab1ab 109674 Danio rerio 2245..3055 Rev
p3E-rab1ba 109675 Danio rerio 929..1739 Fwd
p3E-rab1bb 109676 Danio rerio 2260..3070 Rev
p3E-rab20 109677 Danio rerio 980..1790 Fwd
p3E-rab21 109678 Danio rerio 1061..1871 Fwd
p3E-rab22a 109679 Danio rerio 899..1709 Fwd
p3E-rab23 109680 Danio rerio 1122..1932 Fwd
p3E-rab24 109681 Danio rerio 1017..1827 Fwd
p3E-rab25a 109682 Danio rerio 956..1766 Fwd
p3E-rab25b 109683 Danio rerio 949..1759 Fwd
p3E-rab27a 109685 Danio rerio 977..1787 Fwd
p3E-rab28 109686 Danio rerio 1074..1884 Fwd
p3E-rab2a 109687 Danio rerio 947..1757 Fwd
p3E-rab30 109688 Danio rerio 1014..1824 Fwd
p3E-rab32a 109689 Danio rerio 1050..1860 Fwd
p3E-rab32b 109690 Danio rerio 1044..1854 Fwd
p3E-rab33a 109691 Danio rerio 1119..1929 Fwd
p3E-rab33ba 109692 Danio rerio 1037..1847 Fwd
p3E-rab34a 109693 Danio rerio 1188..1998 Fwd
p3E-rab34b 109694 Danio rerio 1078..1888 Fwd
p3E-rab35b 109696 Danio rerio 924..1734 Fwd
p3E-rab36 109697 Danio rerio 1197..2007 Fwd
p3E-rab38a 109699 Danio rerio 1061..1871 Fwd
p3E-rab39ba 109701 Danio rerio 1071..1881 Fwd
p3E-rab39bb 109702 Danio rerio 2292..3102 Rev
p3E-rab3aa 109703 Danio rerio 1071..1881 Fwd
p3E-rab3ab 109704 Danio rerio 984..1794 Fwd
p3E-rab3c 109705 Danio rerio 976..1786 Fwd
p3E-rab3da 109706 Danio rerio 1098..1908 Fwd
p3E-rab3db 109707 Danio rerio 1087..1897 Fwd
p3E-rab40b 109708 Danio rerio 1172..1982 Fwd

DNA Sequence Variants

Sequence context may differ across plasmids due to position and neighboring features.

DNA Sequence (810 bp)
ATGAGCCATATTCAACGGGAAACGTCGAGGCCGCGATTAAATTCCAACATGGATGCTGATTTATATGGGTATAAATGGGCTCGCGATAATGTCGGGCAATCAGGTGCGACAATCTATCGCTTGTATGGGAAGCCCGATGCGCCAGAGTTGTTTCTGAAACATGGCAAAGGTAGCGTTGCCAATGATGTTACAGATGAGATGGTCAGACTAAACTGGCTGACGGAATTTATGCCTCTTCCGACCATCAAGCATTTTATCCGTACTCCTGATGATGCATGGTTACTCACCACTGCGATCCCCGGAAAAACAGCATTCCAGGTATTAGAAGAATATCCTGATTCAGGTGAAAATATTGTTGATGCGCTGGCAGTGTTCCTGCGCCGGTTGCATTCGATTCCTGTTTGTAATTGTCCTTTTAACAGCGATCGCGTATTTCGTCTCGCTCAGGCGCAATCACGAATGAATAACGGTTTGGTTGATGCGAGTGATTTTGATGACGAGCGTAATGGCTGGCCTGTTGAACAAGTCTGGAAAGAAATGCATAAACTTTTGCCATTCTCACCGGATTCAGTCGTCACTCATGGTGATTTCTCACTTGATAACCTTATTTTTGACGAGGGGAAATTAATAGGTTGTATTGATGTTGGACGAGTCGGAATCGCAGACCGATACCAGGATCTTGCCATCCTATGGAACTGCCTCGGTGAGTTTTCTCCTTCATTACAGAAACGGCTTTTTCAAAAATATGGTATTGATAATCCTGATATGAATAAATTGCAGTTTCATTTGATGCTCGATGAGTTTTTCTAA
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