KanR

CDS antibiotic_resistance

Feature Information

Gene
aph(3')-Ia
Product
aminoglycoside phosphotransferase
Note
confers resistance to kanamycin in bacteria or G418 (Geneticin(R)) in eukaryotes
Type
CDS
Category
antibiotic_resistance

Protein Sequence

271 amino acids
MSHIQRETSCSRPRLNSNMDADLYGYKWARDNVGQSGATIYRLYGKPDAPELFLKHGKGSVANDVTDEMVRLNWLTEFMPLPTIKHFIRTPDDAWLLTTAIPGKTAFQVLEEYPDSGENIVDALAVFLRRLHSIPVCNCPFNSDRVFRLAQAQSRMNKGLVDASDFDDERNGWPVEQVWKEMHKLLPFSPDSVVTHGDFSLDNLIFDEGKLIGCIDVGRVGIADRYQDLAILWNCLGEFSPSLQKRLFQKYGIDNPDMNKLQFHLMLDEFF

Found in 4,204 Plasmids (showing 2301–2350)

Plasmid Species Position Strand
pDONR221-zgc:152904 192740 Danio rerio 2633..3443 Fwd
pDONR221-dyrk1aa 192741 Danio rerio 0..4764 Fwd
pDONR221-brwd1 192742 Danio rerio 0..9111 Rev
pDONR221-olig2 192743 Danio rerio 1777..2587 Fwd
pDONR221-olig1 192744 Danio rerio 1663..2473 Fwd
pDONR221-appa 192745 Danio rerio 1009..1819 Fwd
pDONR221-appb 192746 Danio rerio 0..4647 Fwd
pDONR221-mis18a 192747 Danio rerio 1534..2344 Fwd
pTwist-ENTR-rbm11-203 192749 Danio rerio 1540..2356 Rev
pTwist-ENTR-NP_001373296.1 192750 Danio rerio 1708..2524 Rev
pLN-AIDA-Tyr1 192831 Synthetic 4604..5420 Rev
pET28-6xhis-sumo-CeMIGA(106-496) 192832 Caenorhabditis elegans 3342..4158 Rev
pET29-hMIGA2(170-593)-6xhis 192834 Homo sapiens 575..1391 Rev
pET29-hMIGA2(306-593)-6xhis 192837 Homo sapiens 560..1376 Rev
pCA528 CAPN7 (1-75) 193031 Homo sapiens 558..1374 Rev
pCA528 CAPN7 (81-165) 193032 Homo sapiens 558..1374 Rev
pCA528 CAPN7 L61D (1-165) 193033 Homo sapiens 558..1374 Rev
pCA528 CAPN7 V18D,F98D (1-165) 193034 Homo sapiens 558..1374 Rev
pCA528 IST1 L328D (316-366)(C-Cys) 193035 Homo sapiens 558..1374 Rev
pCA528 IST1 L355A (316-366)(C-Cys) 193036 Homo sapiens 558..1374 Rev
pCA528 IST1 L328D,L355A (316-366)(C-Cys) 193037 Homo sapiens 558..1374 Rev
pCA528 IST1 (322-366) 193038 Homo sapiens 558..1374 Rev
pCA528 IST1 (1-366) 193039 Homo sapiens 558..1374 Rev
pCA528 IST1 L328D, L355A (1-366) 193040 Homo sapiens 558..1374 Rev
KAN(G418)-TET-OFF – ubiquitin – LEU – 4FLAG 193317 Saccharomyces cerevisiae 2852..3662 Rev
KAN(G418)-TET-OFF – ubiquitin – LEU – 4MYC 193318 Saccharomyces cerevisiae 2839..3649 Rev
pETM30-C9ORF78 193367 Homo sapiens 566..1382 Rev
pETM30-C9ORF78_R41A 193368 Homo sapiens 566..1382 Rev
pETM30-C9ORF78_F8A 193369 Homo sapiens 558..1374 Rev
pOPINB-HOIL-1 full-length (1–510) 193858 Homo sapiens 685..1501 Rev
pOPINB-HOIL-1 helix-RBR (233–510) 193859 Homo sapiens 607..1423 Rev
1BR9-Lifeact 193863 Synthetic 1150..1966 Rev
1BR9-AtWUS 193865 Arabidopsis thaliana 2267..3083 Rev
1B-GFP1-10 193867 Synthetic 1588..2404 Rev
pCEV-G2-Km ymTurquoise2 193958 Synthetic 6517..7327 Fwd
pCEV-G2-Km ymNeongreen 193959 Synthetic 6508..7318 Fwd
pCEV-G2-Km ymScarletI 193960 Synthetic 6496..7306 Fwd
pIS002 194013 Mus musculus 0..3980 Rev
pIS003 194014 Mus musculus 81..897 Rev
pET28a FKBP12-V5 194117 Homo sapiens 4284..5100 Fwd
TDP-43 _CTD_5M→A_CR 194263 Homo sapiens 2557..3367 Fwd
TDP-43 _CTD_5M→A_IDR 194264 Homo sapiens 2862..3672 Fwd
TDP-43 _CTD_5M→L_IDR 194265 Homo sapiens 2959..3769 Fwd
TDP-43 _CTD_5M→Y_IDR 194266 Homo sapiens 2918..3728 Fwd
TDP-43 _CTD_5A→M_IDR 194267 Homo sapiens 2562..3372 Fwd
TDP-43 _CTD_5A→M_IDR + 5M→A_CR 194268 Homo sapiens 2959..3769 Fwd
TDP-43 _CTD_6F→A 194269 Homo sapiens 3828..4644 Rev
p3E-DrCavin1a 194291 Danio rerio 1936..2746 Fwd
p3E-DrCavin1b 194292 Danio rerio 1746..2556 Fwd
pET29_LuxSit_i 194299 Synthetic 4274..5090 Fwd

DNA Sequence Variants

Sequence context may differ across plasmids due to position and neighboring features.

DNA Sequence (810 bp)
ATGAGCCATATTCAACGGGAAACGTCGAGGCCGCGATTAAATTCCAACATGGATGCTGATTTATATGGGTATAAATGGGCTCGCGATAATGTCGGGCAATCAGGTGCGACAATCTATCGCTTGTATGGGAAGCCCGATGCGCCAGAGTTGTTTCTGAAACATGGCAAAGGTAGCGTTGCCAATGATGTTACAGATGAGATGGTCAGACTAAACTGGCTGACGGAATTTATGCCTCTTCCGACCATCAAGCATTTTATCCGTACTCCTGATGATGCATGGTTACTCACCACTGCGATCCCCGGAAAAACAGCATTCCAGGTATTAGAAGAATATCCTGATTCAGGTGAAAATATTGTTGATGCGCTGGCAGTGTTCCTGCGCCGGTTGCATTCGATTCCTGTTTGTAATTGTCCTTTTAACAGCGATCGCGTATTTCGTCTCGCTCAGGCGCAATCACGAATGAATAACGGTTTGGTTGATGCGAGTGATTTTGATGACGAGCGTAATGGCTGGCCTGTTGAACAAGTCTGGAAAGAAATGCATAAACTTTTGCCATTCTCACCGGATTCAGTCGTCACTCATGGTGATTTCTCACTTGATAACCTTATTTTTGACGAGGGGAAATTAATAGGTTGTATTGATGTTGGACGAGTCGGAATCGCAGACCGATACCAGGATCTTGCCATCCTATGGAACTGCCTCGGTGAGTTTTCTCCTTCATTACAGAAACGGCTTTTTCAAAAATATGGTATTGATAATCCTGATATGAATAAATTGCAGTTTCATTTGATGCTCGATGAGTTTTTCTAA
Protein Sequence (269 aa)
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DNA Sequence (810 bp)
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DNA Sequence (810 bp)
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DNA Sequence (810 bp)
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Protein Sequence (271 aa)
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