Sce VMA intein 5' region

CDS coding

Feature Information

Gene
Saccharomyces cerevisiae VMA1
Product
5' region of the intein from the yeast Vma1 subunit of the vacuolar ATPase (Chong et al., 1998)
Type
CDS
Category
coding

Protein Sequence

273 amino acids
CFAKGTNVLMADGSIECIENIEVGNKVMGKDGRPREVIKLPRGRETMYSVVQKSQHRAHKSDSSREVPELLKFTCNATHELVVRTPRSVRRLSRTIKGVEYFEVITFEMGQKKAPDGRIVELVKEVSKSYPISEGPERANELVESYRKASNKAYFEWTIEARDLSLLGSHVRKATYQTYAPILYENDHFFDYMQKSKFHLTIEGPKVLAYLLGLWIGDGLSDRATFSVDSRDTSLMERVTEYAEKLNLCAEYKDRKEPQVAKTVNLYSKVVRG

Found in 38 Plasmids

Plasmid Species Position Strand
MT2a 105693 Homo sapiens 5199..6018 Fwd
MT2a_K30A 105694 Homo sapiens 5173..5992 Fwd
MT2a_K31A 105695 Homo sapiens 5187..6006 Fwd
MT2a_K30A K31A 105696 Homo sapiens 5200..6019 Fwd
MT2a_C21A 105697 Homo sapiens 5189..6008 Fwd
MT2a_K20A 105698 Homo sapiens 5389..6208 Fwd
MT2a_S6A 105699 Homo sapiens 5192..6011 Fwd
MT1A 105700 Homo sapiens 3573..4392 Fwd
MT1B 105701 Homo sapiens 5193..6012 Fwd
MT1E 105702 Homo sapiens 498..1317 Fwd
MT1F 105703 Homo sapiens 5204..6023 Fwd
MT1G 105704 Homo sapiens 468..1287 Fwd
MT1G_isoform2 105705 Homo sapiens 282..1101 Fwd
MT1H 105706 Homo sapiens 5200..6019 Fwd
MT1K 105707 Homo sapiens 5206..6025 Fwd
MT1K_K20T 105708 Homo sapiens 5189..6008 Fwd
MT1X 105709 Homo sapiens 5188..6007 Fwd
MT3 105710 Homo sapiens 3565..4384 Fwd
MT4 105711 Homo sapiens 3573..4392 Fwd
MT4_C30Y R31W 105712 Homo sapiens 5199..6018 Fwd
pSW149 122248 Saccharomyces cerevisiae 2950..3769 Fwd
His_Naa80d in pTYB12 188455 Homo sapiens 6301..7120 Fwd
pET23PI-Sce ESARC 195607 Saccharomyces cerevisiae 0..5027 Fwd
pET23PI-Sce ESARC D218A 195608 Saccharomyces cerevisiae 295..1114 Fwd
pT7PI-Sce ESARC D326A 195609 Saccharomyces cerevisiae 0..3801 Fwd
MT2A_beta-domain 200300 Homo sapiens 5756..6575 Fwd
MT2A_beta-Villin 200301 Homo sapiens 5747..6566 Fwd
MT2A_alpha-domain 200302 Homo sapiens 5769..6588 Fwd
pDual 207883 Saccharomyces cerevisiae 1669..2488 Fwd
pEndo-I-OnuI-TSM 207954 Saccharomyces cerevisiae 1669..2488 Fwd
pTYB1-MeCP2-R168X (pc4734 ) 249081 Homo sapiens 1793..2612 Fwd
pTYB1-MeCP2-R255X (pc4735) 249082 Homo sapiens 5000..5819 Fwd
pTYB1-GFP-MeCP2 (pc4741 ) 249083 Homo sapiens 6008..6827 Fwd
pTYB1-GFP-MeCP2-R168X (pc4742 ) 249084 Homo sapiens 6467..7286 Fwd
pTYB1-GFP-MeCP2-R255X (pc4743 ) 249085 Homo sapiens 5312..6131 Fwd
MBP-TEV-VMA Model vector 86590 Saccharomyces cerevisiae 2773..3592 Fwd
pTYB11-PTBP1-RRM1 89153 Homo sapiens 3342..4161 Fwd
pTYB11-PTBP1-RRM2CCtoSS 89154 Homo sapiens 3339..4158 Fwd

DNA Sequence Variants

Sequence context may differ across plasmids due to position and neighboring features.

DNA Sequence (819 bp)
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